当前解析结果
SmilChr02G004609| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004609 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004609 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G004609 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 68585615 - 68590037 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008606 |
|---|---|
| GeneID | 131008606 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008606 |
| 原始查询 | SmilChr02G004609 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819775]; symbol=DAC; hit=AT3G17930; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819775]; symbol=DAC; hit=AT3G17930; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT3G17930 (DAC)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819775] identity=53.4; qcov=0.981; evalue=6.11e-67; confidence=high |
| Rice | Os01g0805200- identity=72.7; qcov=0.571; evalue=4.96e-63; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF11460 (DUF3007) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008606 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057791522.1 |
| 2 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 1.00000 | XP_057791522.1 |
| 3 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 0.80000 | XP_057791522.1 |
| 4 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.20000 | XP_057791522.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057791522.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:68585993 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C1,D6 |
Chr2:68589896 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B103,B127,B54 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057791522.1PF11460
DUF3007 104-185 aa
XP_057791523.1PF11460
DUF3007 104-199 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057791522.1 |
Pfam | PF11460 |
DUF3007 | Family | 104 | 185 | 1.5e-27 | 96.3 | Protein of unknown function (DUF3007) |
XP_057791523.1 |
Pfam | PF11460 |
DUF3007 | Family | 104 | 199 | 2.7e-34 | 118.0 | Protein of unknown function (DUF3007) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。