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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004616`

染色体: Chr02 坐标: 68672190-68677845 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004616`
名称	SmilChr02G004616
描述	uncharacterized SmilChr02G004616
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68672190 - 68677845 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008583`
GeneID	`131008583`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008583`
原始查询	`SmilChr02G004616`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0745600; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os02g0745600; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT5G61910` (AT5G61910) DCD (Development and Cell Death) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836312] identity=41.6; qcov=0.438; evalue=2.74e-45; confidence=low
Rice	`Os02g0745600` - identity=51; qcov=0.28; evalue=7e-46; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10539 (Dev_Cell_Death)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008583

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791497.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791497.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791497.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791497.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791497.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68672421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr2:68672421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:68672685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr2:68672721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr2:68672883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C2
`Chr2:68673000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr2:68673715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr2:68673753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr2:68673838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:68673858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B82,B86,C27,D7
`Chr2:68675112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B70,B91
`Chr2:68675269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791497.1

532 aa

266

532

Dev_Cell_Death

PF10539 Dev_Cell_Death 48-168 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791497.1`	Pfam	`PF10539`	Dev_Cell_Death	Domain	48	168	4.6e-45	153.2	Development and cell death domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935514.1
TAAATTTTCTTACTTTTGTTCGGTTAAAACCTTCTTTAAAATCTTATAATCACGTGCATTATAAATACAAACTCAATTTGCACCATGATGAGCGCGAAATTGTGTGCTTCTTGACGCGATTTGACAGCAAACTTGCCACAGTTCGATTTCCCATGGTCAGTCCAGCAAAAACTATGATCCCTGCTCCTGCTACTCTTACTTACTCAACTGAGGCTAACGCTTCTGACCCTGGAAGCCACAAAAATGGAGCTTCAGCTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008583
ATGGTCAGTCCAGCAAAAACTATGATCCCTGCTCCTGCTACTCTTACTTACTCAACTGAGGCTAACGCTTCTGACCCTGGAAGCCACAAAAATGGAGCTTCAGCTGAAGACAATGAAAGGGAAACAACTGAATGCCTTTCTGGTTTTATATTCCTCTGTAATCAGACCACAAAGTTGCAATGTTATCAATACCGTGTCTTTGGACTTCCATGGGGCCAAAAGGGAGCGGCGGAGAAGATAAAGCCTGGGTCAAAGCTATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791497.1
MVSPAKTMIPAPATLTYSTEANASDPGSHKNGASAEDNERETTECLSGFIFLCNQTTKLQCYQYRVFGLPWGQKGAAEKIKPGSKLFLFDFKSKLLYGVYEATSDGGLNLEPAAFGGKFPAQVKFKIFKECLPIPESSLRYVIKENYTGAKFKQELDVKQVTKLISAFSPLAASICQPAPQPLVQPASISQPAPQPLAVSICQPAPQPRPGAIPPSLLEYQHKLTGRLPMMEAPYLAQVQYNNILPPVEARPVLNITYPE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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