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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004619`

染色体: Chr02 坐标: 68700932-68727977 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004619`
名称	SmilChr02G004619
描述	callose synthase 10
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68700932 - 68727977 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008560`
GeneID	`131008560`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008560`
原始查询	`SmilChr02G004619`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	callose synthase 10
产物	callose synthase 10
Arabidopsis	`AT2G36850` (GSL8) glucan synthase-like 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818258] identity=77.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0119500` (CRR1) - identity=62; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000148 (1,3-beta-D-glucan synthase complex); GO:0003843 (1,3-beta-D-glucan synthase activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006075 ((1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF02364 (Glucan_synthase); PF14288 (FKS1_dom1); PF25968 (CALS1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008560

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057791461.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791461.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791461.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791461.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791461.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68701371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:68703243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,D1
`Chr2:68703347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B27,B44
`Chr2:68704496`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:68705644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr2:68705988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:68707355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:68707959`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr2:68708520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B61
`Chr2:68708566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr2:68708577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr2:68708578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791461.1

1904 aa

952

1904

FKS1_dom1

CALS1

Glucan_synthase

PF14288 FKS1_dom1 345-453 aa PF25968 CALS1 843-1020 aa PF02364 Glucan_synthase 1027-1796 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791461.1`	Pfam	`PF14288`	FKS1_dom1	Family	345	453	4.6e-40	137.1	1,3-beta-glucan synthase subunit FKS1, domain-1
`XP_057791461.1`	Pfam	`PF25968`	CALS1	Domain	843	1020	4.8e-49	167.2	Callose synthase 1 domain
`XP_057791461.1`	Pfam	`PF02364`	Glucan_synthase	Family	1027	1796	6.4e-233	776.2	1,3-beta-glucan synthase component

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935478.1
AAAGAAAAACAATATGAGAATTAAGAAAAGCGTCAAACATTTGAAAAGCTTCTCGACTAAGGCGGAGGGTTTACGAGATAAAGTCTTATTCTGAAACCCCAGCATCAAAGTATATTTTGAATCTTCGTTTGCGCGTCCAAATTCTTGCTCACACCGTTGATCAAAGTCTACTTTACCACATCTGCAAATGAGTTGCATCGCACATTCCTTCAACTTCGACTAGATCTTCCCGAATTGGATTCATTTGCAGAACTAGAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008560
ATGGCTAGGGTTCAGGACAATTGGGAGAGGCTGGTTCGCGCCGTGCTGCGGAGCGAGCAACGGGCCGGCCACGAGCGGACACCCAGCGGCATCGCCGGCGCCGTACCTGACTCGCTTCAACGGAGCACCAACATCAATGCGATTTTGCAGGCTGCCGATGAAATTCAGTCGGAGGATCCCAATGTTGCTAGAATACTATGTGAGCAGGCATATAGTATGGCTCAGAATCTGGACCCCAGCAGCGATGGTAGAGGCGTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791461.1
MARVQDNWERLVRAVLRSEQRAGHERTPSGIAGAVPDSLQRSTNINAILQAADEIQSEDPNVARILCEQAYSMAQNLDPSSDGRGVLQFKTGLMSVIKQKLAKKGGGPIDRNRDIELLWDFYNRFKKRHRVDDIEREEQKWRESGTFSANIGDLDLRFSKMKRVFATLRALVEVMEALSKDAAPEGVGRLVLDELRRLKKSDATISGELIPYNIVPLEAPSLTNAIGYFPEVRGAISAIRYTEQFPRLPADFEISGQRDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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