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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004620`

染色体: Chr02 坐标: 68730086-68732756 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004620`
名称	SmilChr02G004620
描述	GDSL esterase/lipase At3g48460-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68730086 - 68732756 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008596`
GeneID	`131008596`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008596`
原始查询	`SmilChr02G004620`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDSL esterase/lipase At3g48460-like
产物	GDSL esterase/lipase At3g48460-like
Arabidopsis	`AT3G48460` (AT3G48460) GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824005] identity=54.5; qcov=0.958; evalue=1.97e-142; confidence=high
Rice	`Os03g0844600` (OsGELP54) - identity=54.2; qcov=0.906; evalue=1.98e-133; confidence=high
GO	GO:0016788 (hydrolase activity, acting on ester bonds)
KEGG	-
Pfam	PF00657 (Lipase_GDSL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008596

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057791511.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057791511.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791511.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791511.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791511.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68730283`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B101
`Chr2:68730283`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B101
`Chr2:68730287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr2:68730320`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:68732115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B55
`Chr2:68732145`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr2:68732153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,D1
`Chr2:68732187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B124,B23,C25
`Chr2:68732206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B93,C2,C54
`Chr2:68732363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C60
`Chr2:68732523`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B55
`Chr2:68732609`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A4,B7,C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791511.1

385 aa

192

385

Lipase_GDSL

PF00657 Lipase_GDSL 40-363 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791511.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	40	363	7.5e-28	98.8	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935528.1
AAACCTTTTTCTTTTTGTTTTTCTAATGATTACTAACGAATTAATAAGCTGCACCTCGTAGGTAGTCTCATTAATTATATAAACCTTGATCCCACACTAGCTCCAAAACTCAAATCCAAAAAAAAAGAAAAAGATGGCAAAGCTTGGCCGTCCTCACCATCATATCCACCCCATCTTCATCTTCATCATCCTAATAATCCCGACCTTCGTCAATGGCGCCAATCAAAACCCTCGGCCGCCTTTCAAGAAGGTTTACGCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008596
ATGGCAAAGCTTGGCCGTCCTCACCATCATATCCACCCCATCTTCATCTTCATCATCCTAATAATCCCGACCTTCGTCAATGGCGCCAATCAAAACCCTCGGCCGCCTTTCAAGAAGGTTTACGCCTTCGGCGACTCGTACACCGACACCGGCAACACCCACTCCGACAGCGGCCCCAGCGGGTTTATGTTCGTCTCCCACCTTCCCTACGGCCGCACATTCTTCCACCGCCCCACCAACCGCTACTCCGACGGCCGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791511.1
MAKLGRPHHHIHPIFIFIILIIPTFVNGANQNPRPPFKKVYAFGDSYTDTGNTHSDSGPSGFMFVSHLPYGRTFFHRPTNRYSDGRLVIDFXARALSLPLLPPYLGVKSAAPSGSVNFAVAGSTAIVHSFFAKNNMTLNITPQSISTQLGWFEKMAARFGCRDKSSTPKECEAVFNEALIWVGEIGANDYAYSFGSSVTPQTIQRLSINSVTAFLQALMKKGAKYVVVQGLPPTGCLTLSMYLAPSDDRDGVGCVGSANN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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