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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004623`

染色体: Chr02 坐标: 68739106-68739576 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004623`
名称	SmilChr02G004623
描述	polcalcin Che a 3-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68739106 - 68739576 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008617`
GeneID	`131008617`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008617`
原始查询	`SmilChr02G004623`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polcalcin Che a 3-like
产物	polcalcin Che a 3-like
Arabidopsis	`AT5G17480` (PC1) pollen calcium-binding protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28721170] identity=71.6; qcov=0.953; evalue=9.65e-36; confidence=medium
Rice	`Os08g0560700` - identity=69.7; qcov=0.894; evalue=1.06e-33; confidence=medium
GO	GO:0005509 (calcium ion binding)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00036 (EF-hand_1); PF13202 (EF-hand_5); PF13405 (EF-hand_6); PF13499 (EF-hand_7); PF13833 (EF-hand_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008617

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057791538.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057791538.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791538.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791538.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791538.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68739433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C2,C32,C68,C71,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791538.1

85 aa

EF-hand_1

EF-hand_6

EF-hand_7

EF-hand_5

EF-hand_8

EF-hand_1

EF-hand_5

PF00036 EF-hand_1 13-39 aa PF13405 EF-hand_6 14-40 aa PF13499 EF-hand_7 14-71 aa PF13202 EF-hand_5 16-34 aa PF13833 EF-hand_8 32-72 aa PF00036 EF-hand_1 46-72 aa PF13202 EF-hand_5 53-70 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791538.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	13	39	1.3e-18	65.8	EF hand domain
`XP_057791538.1`	Pfam	`PF13405`	EF-hand_6	Domain	14	40	3.6e-15	54.9	EF-hand domain
`XP_057791538.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	14	71	2.1e-15	57.5	EF-hand domain pair
`XP_057791538.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	16	34	3.8e-13	49.0	EF hand
`XP_057791538.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	32	72	5.4e-12	46.0	EF-hand domain pair
`XP_057791538.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	46	72	1.3e-18	65.8	EF hand domain
`XP_057791538.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	53	70	3.8e-13	49.0	EF hand

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935555.1
CTTCCAATTAATTAATTAGTGAGGATCGGAGCAAAATTAATTAAAATTAAGAGAATGGCAGATGAGGATCCACAGGACGTAGCAGACCGGGAGCGCATATTCAAGCACTGTGACACCAATGGCGACGGCAAAGTATCGGCGACGGAGCTCGGAGAGGCCCTCAAGGCGCTCGGCTCCGTCTCCGCTGACGAAGTCAAGCGCATGATGGCTGAGCTCGACACCGATGGCGACGGCTTCATTTCCTTTGACGAGTTCACAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008617
ATGGCAGATGAGGATCCACAGGACGTAGCAGACCGGGAGCGCATATTCAAGCACTGTGACACCAATGGCGACGGCAAAGTATCGGCGACGGAGCTCGGAGAGGCCCTCAAGGCGCTCGGCTCCGTCTCCGCTGACGAAGTCAAGCGCATGATGGCTGAGCTCGACACCGATGGCGACGGCTTCATTTCCTTTGACGAGTTCACAGATTTCGCCAAGGCCAACAGGGGCTTAATTAGGGATGTCGCCAAGATTTTCTAG

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791538.1
MADEDPQDVADRERIFKHCDTNGDGKVSATELGEALKALGSVSADEVKRMMAELDTDGDGFISFDEFTDFAKANRGLIRDVAKIF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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