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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004624`

染色体: Chr02 坐标: 68741887-68742788 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004624`
名称	SmilChr02G004624
描述	probable calcium-binding protein CML27
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68741887 - 68742788 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008614`
GeneID	`131008614`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008614`
原始查询	`SmilChr02G004624`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable calcium-binding protein CML27
产物	probable calcium-binding protein CML27
Arabidopsis	`AT1G18210` (AT1G18210) Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838401] identity=52.5; qcov=0.932; evalue=1.47e-46; confidence=medium
Rice	`Os01g0135700` (OsCML16) - identity=54.7; qcov=0.946; evalue=2.23e-47; confidence=medium
GO	GO:0005509 (calcium ion binding)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00036 (EF-hand_1); PF13202 (EF-hand_5); PF13405 (EF-hand_6); PF13499 (EF-hand_7); PF13833 (EF-hand_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008614

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057791535.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791535.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057791535.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057791535.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791535.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68742231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791535.1

147 aa

147

EF-hand_1

EF-hand_6

EF-hand_7

EF-hand_5

EF-hand_8

EF-hand_5

EF-hand_7

EF-hand_1

EF-hand_6

EF-hand_5

EF-hand_8

EF-hand_1

EF-hand_5

PF00036 EF-hand_1 11-38 aa PF13405 EF-hand_6 12-40 aa PF13499 EF-hand_7 12-71 aa PF13202 EF-hand_5 13-35 aa PF13833 EF-hand_8 25-71 aa PF13202 EF-hand_5 52-71 aa PF13499 EF-hand_7 79-143 aa PF00036 EF-hand_1 81-106 aa PF13405 EF-hand_6 81-110 aa PF13202 EF-hand_5 82-105 aa PF13833 EF-hand_8 94-143 aa PF00036 EF-hand_1 117-143 aa PF13202 EF-hand_5 124-142 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791535.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	11	38	7.6e-31	104.1	EF hand domain
`XP_057791535.1`	Pfam	`PF13405`	EF-hand_6	Domain	12	40	2.7e-27	92.6	EF-hand domain
`XP_057791535.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	12	71	7.6e-30	103.8	EF-hand domain pair
`XP_057791535.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	13	35	4.6e-21	74.0	EF hand
`XP_057791535.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	25	71	1e-16	61.1	EF-hand domain pair
`XP_057791535.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	52	71	4.6e-21	74.0	EF hand
`XP_057791535.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	79	143	7.6e-30	103.8	EF-hand domain pair
`XP_057791535.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	81	106	7.6e-31	104.1	EF hand domain
`XP_057791535.1`	Pfam	`PF13405`	EF-hand_6	Domain	81	110	2.7e-27	92.6	EF-hand domain
`XP_057791535.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	82	105	4.6e-21	74.0	EF hand
`XP_057791535.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	94	143	1e-16	61.1	EF-hand domain pair
`XP_057791535.1`	Pfam	`PF00036`	EF-hand_1	Domain	117	143	7.6e-31	104.1	EF hand domain
`XP_057791535.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	124	142	4.6e-21	74.0	EF hand

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935552.1
ATAATTTGAATGAAACTCTCGAAGGTAGACTAAAAAAGGGTGTGGTCAACTCTTTCGAAATTAATAGATCCGATCACTGGTCCAGCCTTAGAAGTTTTGTAATTAACCACCAAAAAGAAAGAATAAAAGGGGTAACTAATTCTTCACTCTACGCGTCAAAAACGCGTAGCCTTGCTATATAAATTAACACCCACCAAATTAAACGAAACAAAAAAAATAAAAAAGAAATAAAGATTGTTGAGCCGCAGTTAAGAATGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008614
ATGGAGGAAAAGGGAGCAAGCCAAGTAGACGAAGTGGAGAAAGTGTTCAGCAAGTTCGACGCCGACGGCGACCACAAGATCTCTTCAGCTGAGCTGGGCGCCGTGCTGAACAGCCTGGGCGCGGGCGCGTCGAGCGAGGAGGTGGCGCTGATGATGTCGGAGCTGGACGCCGACTGCGACGGCTACATCGATCTGGATGAGTTCAAGTCGTTCCAGCTCCGCGGCGAGGGCGACGAGAAGGAGCTGAGGGAGGCGTTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791535.1
MEEKGASQVDEVEKVFSKFDADGDHKISSAELGAVLNSLGAGASSEEVALMMSELDADCDGYIDLDEFKSFQLRGEGDEKELREAFDLYDKDKNGMISAAELHSVLCSLGEKCSVEDCQRMISSFDVDADGFINFQEFNKMMTGNTS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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