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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004632`

染色体: Chr02 坐标: 68791546-68795838 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004632`
名称	SmilChr02G004632
描述	protein spt2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68791546 - 68795838 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008627`
GeneID	`131008627`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008627`
原始查询	`SmilChr02G004632`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein spt2-like
产物	protein spt2-like
Arabidopsis	`AT2G22720` (AT2G22720) SPT2 chromatin protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816802] identity=46.3; qcov=0.473; evalue=7.28e-30; confidence=medium
Rice	`Os02g0664400` - identity=30.9; qcov=0.949; evalue=1.38e-30; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005730 (nucleolus); GO:0006334 (nucleosome assembly); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0042393 (histone binding)
KEGG	smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF08243 (SPT2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008627

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791550.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057791550.1`
3	Nuclear speckle	核斑点	0.60000	`XP_057791550.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791550.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791550.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68794471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C81
`Chr2:68794653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:68794664`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr2:68794686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:68794783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B52,C48,C82
`Chr2:68794856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:68794984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B126
`Chr2:68795016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B52,C48,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791550.1

433 aa

216

433

SPT2

PF08243 SPT2 350-426 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791550.1`	Pfam	`PF08243`	SPT2	Domain	350	426	8.4e-16	59.2	SPT2 chromatin protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935567.1
AAGCGTATAATTAGGTAGGAGAAAGGAAAAAGAAAAAGGAAATTGTAGATTCTACGGGGAGATATACTCCATTGTTATCCGTGCTATTTTTCATTTGATTAAAAAAGAAGAAGCAATTAGTTTGTTTCCATATATAATTCGGAAATCCATACGTTAATAAAAGCATGGACGCTCAAATGGATGCCATTGCCCGCACGTCGAAAGGAGAGGAGAAAAAACGGACCAAATCCCGGTTCGTCCATCATTCTTATCCTCCACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008627
ATGCGAGGGTATGAAAAAGATGAGTATGAAGATTGGGATGAGTATGAGGAAGATGGAGAGGAGCAAGGTGATGATGGTTATGAAGAAGTTCATCAGCCCACCCAGGAGGAGTTGGATTATCTTGCAATCAGGCAAAAGTTAAAAGAAAAAATCAGAAAGAAGATGATGAAGGATACAAGGACTGCAAACCTTAGTTCCCGTGACAAAGTGAATGCATCACATAAAGACAACTATGGTTCTTTCTTTGGGCCTTCACAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791550.1
MRGYEKDEYEDWDEYEEDGEEQGDDGYEEVHQPTQEELDYLAIRQKLKEKIRKKMMKDTRTANLSSRDKVNASHKDNYGSFFGPSQPVIAQRVIQESKSLLENPELAARFCKTSHKEKKSSVSAPVSSKSQANCLPSVKKKVELLKNTRDYSFLLSDDAEVPASSKGPPPRNVSAPKSDARSAKSMPRSRPVINGRGREVSNGRDGRKPMLPCSQSKSKVGMDKLAQTNKPSTDSRKLFGNNSGSGPGRPLGPKVAPAKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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