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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004643`

染色体: Chr02 坐标: 68869654-68871209 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004643`
名称	SmilChr02G004643
描述	putative pectinesterase/pectinesterase inhibitor 28
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68869654 - 68871209 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009924`
GeneID	`131009924`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009924`
原始查询	`SmilChr02G004643`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative pectinesterase/pectinesterase inhibitor 28
产物	putative pectinesterase/pectinesterase inhibitor 28
Arabidopsis	`AT5G27870` (AT5G27870) Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832850] identity=36.9; qcov=1.22; evalue=6.21e-58; confidence=medium
Rice	`Os03g0300500` (OsPME10) - identity=34.1; qcov=1.24; evalue=1e-47; confidence=low
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification); GO:0046910 (pectinesterase inhibitor activity)
KEGG	-
Pfam	PF01095 (Pectinesterase); PF04043 (PMEI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009924

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057793306.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793306.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793306.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793306.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793306.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68869654`	`T`	`TTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	20	A4,B1,B102,B104,B107,B127,B135,B16,B70,B71,C35,C57,C58,C60,C62,C73,C76,D4,D5,D8
`Chr2:68869661`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	39	A5,B114,B119,B121,B133,B139,B140,B17,B18,B19,B2,B20,B24,B40,B42,B43,B56,B62,B65,B66,B69,B84,C19,C23,C28,C39,C45,C46,C49,C52,C54,C64,C66,C69,C78,C79,C80,C82,C87
`Chr2:68869664`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	18	A4,B1,B102,B104,B127,B135,B16,B70,B71,C35,C57,C58,C60,C62,C76,D4,D5,D8
`Chr2:68869666`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B107,C73
`Chr2:68869666`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B107,C73
`Chr2:68869667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:68869670`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	20	A4,B1,B102,B104,B107,B127,B135,B16,B70,B71,C35,C57,C58,C60,C62,C73,C76,D4,D5,D8
`Chr2:68869687`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A4,B1,B102,B104,B107,B114,B127,B135,B16,B70,B71,C35,C57,C58,C60,C62,C73,C76,D4,D5,D8
`Chr2:68869691`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	21	A4,B1,B102,B104,B107,B114,B127,B135,B16,B70,B71,C35,C57,C58,C60,C62,C73,C76,D4,D5,D8
`Chr2:68869749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,C45,C64,C66,C83
`Chr2:68869781`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	106	A14,A16,A19,A21,A23,A25,A5,A6,A8,B100,B110,B112,B114,B115,B118,B121,B126,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B16,B17,B18,B19,B20,B21,B26,B27,B29,B33,B34,B35,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B56,B58,B6,B61,B62,B65,B67,B68,B73,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B87,B9,B90,B91,B92,B96,B97,C10,C11,C13,C16,C19,C21,C24,C26,C28,C30,C33,C38,C41,C43,C44,C46,C50,C52,C54,C59,C60,C64,C65,C66,C67,C69,C70,C80,C81,C83,C84,C85,C86,C87
`Chr2:68869788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793306.1

258 aa

129

258

PMEI

Pectinesterase

PF04043 PMEI 4-82 aa PF01095 Pectinesterase 90-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793306.1`	Pfam	`PF04043`	PMEI	Domain	4	82	3.5e-10	40.9	Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor
`XP_057793306.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	90	256	1.4e-52	179.0	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937323.1
ATGACGCAGGGGGCGTTGATGGTGTGTGAAGAGATGCTCAACACCGCCATTGATGATCTTATAAGGTCGTCCGACAAAGTGAACAAGATCGAAATGGGACGGCTGAGCTACAACATCGCCGCCATGAGGAACTGGCTCAGCGCAGCCGTCACGCACAAGGAGAATTGCATTGATGAGCTCGAGACCACTGCAGGTGAGATCGGTGAGAAGGTGAAGGCGATGCTGGAGACTTCAAGCGAGTTGTTGAGCGGCTGTGGCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009924
ATGACGCAGGGGGCGTTGATGGTGTGTGAAGAGATGCTCAACACCGCCATTGATGATCTTATAAGGTCGTCCGACAAAGTGAACAAGATCGAAATGGGACGGCTGAGCTACAACATCGCCGCCATGAGGAACTGGCTCAGCGCAGCCGTCACGCACAAGGAGAATTGCATTGATGAGCTCGAGACCACTGCAGGTGAGATCGGTGAGAAGGTGAAGGCGATGCTGGAGACTTCAAGCGAGTTGTTGAGCGGCTGTGGCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793306.1
MTQGALMVCEEMLNTAIDDLIRSSDKVNKIEMGRLSYNIAAMRNWLSAAVTHKENCIDELETTAGEIGEKVKAMLETSSELLSGCGSECDGSGQFMTINGALKSLPQMSDAPVVVLVKAGVYKEYVVVPKGMNNVALIGDEPLATVISGSRGNATDYRTSYSATLTIRGEGDIGIENTAPTNQAVAVLTAGDKAVFHNVHIDSLYANSYRQFYRDCRIRGTVDFIFGDAVAVLQNCTITVRKPLPKQYCTITARRRPP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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