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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004656`

染色体: Chr02 坐标: 68975397-68976452 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004656`
名称	SmilChr02G004656
描述	uncharacterized SmilChr02G004656
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68975397 - 68976452 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009925`
GeneID	`131009925`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009925`
原始查询	`SmilChr02G004656`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=56.7; qcov=0.296; evalue=1.17e-37; confidence=weak
Rice	`Os01g0872900` - identity=51.1; qcov=1; evalue=1.56e-127; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009925

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793307.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057793307.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057793307.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793307.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793307.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68975399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B120,B77,C48,C6
`Chr2:68975411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B102,B124,B23,C25
`Chr2:68975412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B18,B91,C79
`Chr2:68975416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B104,B16,C79
`Chr2:68975423`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	29	A23,B113,B124,B129,B13,B130,B14,B140,B26,B27,B41,B44,B63,B68,B69,B75,B93,B95,C1,C14,C19,C29,C35,C4,C41,C60,C71,C72,C87
`Chr2:68975429`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	A1,A14,A16,A19,A23,B108,B111,B118,B121,B45,B48,B50,B54,B57,B59,B88,C15,C20,C23,C27
`Chr2:68975433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	29	A23,B113,B124,B129,B13,B130,B14,B140,B26,B27,B41,B44,B63,B68,B69,B75,B93,B95,C1,C14,C19,C29,C35,C4,C41,C60,C71,C72,C87
`Chr2:68975442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B18,B91,C79
`Chr2:68975461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,C13,C41
`Chr2:68975467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B85
`Chr2:68975469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B18,B91,C79
`Chr2:68975490`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	B127,B32,B46,B60,B74,B79,C36,C4,C61,C75,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793307.1

351 aa

176

351

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF04827 Plant_tran 74-275 aa PF13359 DDE_Tnp_4 103-266 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793307.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	74	275	8.5e-107	356.1	Plant transposon protein
`XP_057793307.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	103	266	8.1e-10	39.3	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937324.1
ATGAACAAGCTCGTCGCCACCGATAGATTTTTTCAACAACACCCTGATGCAGCTGGCCGTCTTGGTATGTCTCCAATTCAAAAATGTATTGTGGCTATGAGGGTTTTGGCATATGGCACCTCAGCTGACTTGCATGACGAATACTTACGAATGAGTGCCCAAGTCATTCGTAAGTCAGTCATCAAATTTGTTGAAGGTGTCATTTTCAATTTCGGAGCTGAGTACCTCAGAAAGCCAACTGAAGAAGATATGGCAGCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009925
ATGAACAAGCTCGTCGCCACCGATAGATTTTTTCAACAACACCCTGATGCAGCTGGCCGTCTTGGTATGTCTCCAATTCAAAAATGTATTGTGGCTATGAGGGTTTTGGCATATGGCACCTCAGCTGACTTGCATGACGAATACTTACGAATGAGTGCCCAAGTCATTCGTAAGTCAGTCATCAAATTTGTTGAAGGTGTCATTTTCAATTTCGGAGCTGAGTACCTCAGAAAGCCAACTGAAGAAGATATGGCAGCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793307.1
MNKLVATDRFFQQHPDAAGRLGMSPIQKCIVAMRVLAYGTSADLHDEYLRMSAQVIRKSVIKFVEGVIFNFGAEYLRKPTEEDMAALLHIGKRRGFPGMMGSIDCMHWEWKNCPTAWARQYAGRSGTPTIILEAVASQDLWIWHAFFGTPGSRNDINVLDQSPVFDDILEGRAPKVNYIVNGRERNMGYYLTDGIYPQWAAFIKSILAPQLRKHQLFAQHQEAARKDVERAFGVLQARFAFIKRPCLIWDRDIMGKIMIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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