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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004657`

染色体: Chr02 坐标: 68983438-68984622 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004657`
名称	SmilChr02G004657
描述	probable gamma-secretase subunit PEN-2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	68983438 - 68984622 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008650`
GeneID	`131008650`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008650`
原始查询	`SmilChr02G004657`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable gamma-secretase subunit PEN-2
产物	probable gamma-secretase subunit PEN-2
Arabidopsis	`AT5G09310` (AT5G09310) gamma-secretase subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830790] identity=63; qcov=0.804; evalue=3.36e-49; confidence=medium
Rice	`Os01g0960000` - identity=58.3; qcov=0.777; evalue=5.84e-43; confidence=medium
GO	GO:0070765 (gamma-secretase complex)
KEGG	smil04519 (Cadherin signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF10251 (PEN-2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008650

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057791588.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057791588.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057791588.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057791588.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791588.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:68983642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr2:68984459`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C1
`Chr2:68984459`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C1
`Chr2:68984461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791588.1

148 aa

148

PEN-2

PF10251 PEN-2 48-138 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791588.1`	Pfam	`PF10251`	PEN-2	Family	48	138	1.4e-26	93.4	Presenilin enhancer-2 subunit of gamma secretase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935605.1
GCTCGGATCGACCCGGCGTCAGTCAACCCGAACCATAATTTATTTAAAATAGAAAATCGAGCTACACCTTATGTAATCAAAATAGACGAGTAACAGTTTCTTTACCATAACACTTGTGGCATGGACGACGATTCTAGGACCCCTTTCTCCAATCTCGCCGCCGCCGGGAGCGTTCTCCCCACTACCGACGAGGCTTCATCGTCAACAATTAGGTCGGTGCGGACCGAATGGCCGACGATCGACGGCCCTCTCGGCCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008650
ATGGACGACGATTCTAGGACCCCTTTCTCCAATCTCGCCGCCGCCGGGAGCGTTCTCCCCACTACCGACGAGGCTTCATCGTCAACAATTAGGTCGGTGCGGACCGAATGGCCGACGATCGACGGCCCTCTCGGCCTCTCTCACGAGGATTCGCTAACCTACGCCCGTAGATTCTTCAAATTGGGGTTTTTGTGCCTGCCGTTCCTGTGGGCGGTTAGTTGCTTCTATTTCTGGCCTGTCCTCCGCCACCCCCGTTCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791588.1
MDDDSRTPFSNLAAAGSVLPTTDEASSSTIRSVRTEWPTIDGPLGLSHEDSLTYARRFFKLGFLCLPFLWAVSCFYFWPVLRHPRSHQSHPRLRRYLVGSAIGFLLFTTILSSWALTFAIGGERLFGHVWGELVMYNVAEKYGLTGWI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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