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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004668`

染色体: Chr02 坐标: 69045149-69048470 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004668`
名称	SmilChr02G004668
描述	replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit D-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69045149 - 69048470 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008660`
GeneID	`131008660`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008660`
原始查询	`SmilChr02G004668`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit D-like
产物	replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit D-like
Arabidopsis	`AT5G08020` (RPA70B) RPA70-kDa subunit B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830696] identity=26.5; qcov=0.687; evalue=5.59e-32; confidence=low
Rice	`Os03g0214100` (OsRPA1) - identity=27.7; qcov=0.72; evalue=1.09e-35; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006260 (DNA replication); GO:0006281 (DNA repair); GO:0006310 (DNA recombination)
KEGG	-
Pfam	PF08646 (Rep_fac-A_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008660

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791602.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057791602.1`
3	Telomere	端粒	0.60000	`XP_057791602.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791602.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791602.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69046029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr2:69046107`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A3,B126
`Chr2:69046107`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A3,B126
`Chr2:69046126`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A18,A3,B102,B126,B131,B31,C66,C87
`Chr2:69046162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C43,C55
`Chr2:69046300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B38,B63,B77,C57
`Chr2:69046646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr2:69046647`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C38
`Chr2:69046679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B43,B58,C17,C35,C60
`Chr2:69046681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:69046713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B104,B88,B91,C38
`Chr2:69046739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791602.1

511 aa

256

511

Rep_fac-A_C

PF08646 Rep_fac-A_C 282-416 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791602.1`	Pfam	`PF08646`	Rep_fac-A_C	Domain	282	416	1.9e-10	41.4	Replication factor-A C terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935619.1
AGTATAACCGAGTTAGACAGTAATTCAAATATGGTTAGGATAAGGATAAAAATAATTTAATAGATCAAAGACTTGTTATAGAAATCTACAATATTAGAATTAGAATTGTAATAGGAATCAAACTTTCGAATCCACATTATATAATGGTGTATAATTTTTTTGTACACAATCAAATTACAACATATCCGCCTCTAATTTTCTTTCTCTGCTGCGTTTTTGTTTATCTTCTGCGATTGAACGAATTCTTGGATATATAATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008660
ATGACGACAACTGAAACTCTGCAAGTAAATGAAAGATCATTTACAATTGCATTGAAGGCTTTGAGAATAGGCCACGAAGTAAATTGTGGACCTAATTTAAGCACAAAAATCTGGAAATTGATAATGGTTGACAAAGAGGGTGTCCAAATTGGAGTGACAATGTTCAATAATGAAATAAGCAAATTTGGAAAAAAGTTTGAATCCAACAAAACGTATTTAATCTCTAATGGAGAGGTTAGAAACGTTAATACTATGTATCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791602.1
MTTTETLQVNERSFTIALKALRIGHEVNCGPNLSTKIWKLIMVDKEGVQIGVTMFNNEISKFGKKFESNKTYLISNGEVRNVNTMYPSIHREKEIILNRYSDIKEAFDEIEYKIPYNFVEFNDVEQKLDKEEEFDISGMLVQVQKSQQIPIKGVNKAVRNITLMNKKSELVEISLWEDMAKNEGHDLEQITGGKPTVAISYVVAKRKFGGILLQNTMRSVLQITPTCKEIQLIQSCSDVDDDALAIAKLAMAQKIKQAKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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