当前解析结果
SmilChr02G004670| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004670 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004670 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G004670 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 69053031 - 69056012 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131009929 |
|---|---|
| GeneID | 131009929 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009929 |
| 原始查询 | SmilChr02G004670 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os11g0671600; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os11g0671600; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os11g0671600- identity=34.4; qcov=0.901; evalue=3.36e-38; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009929 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057793311.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.80000 | XP_057793311.1 |
| 3 | Telomere | 端粒 | 0.40000 | XP_057793311.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793311.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057793311.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:69053029 |
ATT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | D5 |
Chr2:69053076 |
A |
ATC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 3 | B119,B60,B94 |
Chr2:69053076 |
A |
ATC |
2bp_insertion | CDS_variant | 3 | B119,B60,B94 |
Chr2:69053087 |
T |
TTA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B140 |
Chr2:69053087 |
T |
TTA |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr2:69053095 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C18 |
Chr2:69053099 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B68 |
Chr2:69053110 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 7 | A16,B1,B109,B47,B53,B89,C56 |
Chr2:69053133 |
A |
AAT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B91,C58 |
Chr2:69053133 |
A |
AAT |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | B91,C58 |
Chr2:69053166 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B117,B139 |
Chr2:69053205 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A19,C41,C85 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。