当前解析结果
SmilChr02G004680| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004680 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004680 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G004680 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 69135143 - 69137571 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131008744 |
|---|---|
| GeneID | 131008744 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008744 |
| 原始查询 | SmilChr02G004680 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | carboxypeptidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833786]; symbol=AT5G38060; hit=AT5G38060; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | carboxypeptidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833786]; symbol=AT5G38060; hit=AT5G38060; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT5G38060 (AT5G38060)carboxypeptidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833786] identity=79.3; qcov=0.46; evalue=1.88e-50; confidence=medium |
| Rice | Os08g0364500 (OJ1484_G09.107)- identity=80; qcov=0.423; evalue=1.5e-45; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008744 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057791762.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057791762.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057791762.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791762.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791762.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:69136979 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B110 |
Chr2:69136979 |
GT |
G |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B110 |
Chr2:69137078 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr2:69137493 |
CG |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 12 | A11,A18,A9,B119,B132,B25,B90,B92,C21,C38,C45,D4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。