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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004696`

染色体: Chr02 坐标: 69295395-69295793 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004696`
名称	SmilChr02G004696
描述	uncharacterized protein C6G9.01c
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69295395 - 69295793 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009932`
GeneID	`131009932`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009932`
原始查询	`SmilChr02G004696`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stress response protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831048]; symbol=AT5G11760; hit=AT5G11760; species=arabidopsis; confidence=low
产物	stress response protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831048]; symbol=AT5G11760; hit=AT5G11760; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G11760` (AT5G11760) stress response protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831048] identity=30.2; qcov=1.21; evalue=1.85e-13; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08576 (DUF1764)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009932

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793314.1`
2	Nucleolus	核仁	0.80000	`XP_057793314.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793314.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793314.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793314.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69295423`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	143	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A21,A23,A24,A25,A4,A5,A9,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B107,B108,B109,B11,B110,B117,B12,B121,B123,B125,B126,B127,B129,B13,B131,B132,B136,B137,B139,B14,B140,B19,B20,B23,B26,B28,B31,B32,B33,B34,B37,B4,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B5,B50,B51,B52,B53,B56,B59,B6,B61,B62,B65,B66,B68,B7,B70,B72,B74,B75,B76,B79,B8,B83,B86,B89,B93,B97,B98,B99,C11,C13,C15,C18,C19,C21,C23,C24,C26,C28,C31,C33,C35,C37,C38,C4,C40,C43,C45,C46,C48,C49,C50,C52,C54,C55,C56,C59,C60,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C80,C81,C83,C85,C87,C9,D1,D10,D11,D3,D5,D6,D9
`Chr2:69295426`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	143	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A21,A23,A24,A25,A4,A5,A9,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B107,B108,B109,B11,B110,B117,B12,B121,B123,B125,B126,B127,B129,B13,B131,B132,B136,B137,B139,B14,B140,B19,B20,B23,B26,B28,B31,B32,B33,B34,B37,B4,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B5,B50,B51,B52,B53,B56,B59,B6,B61,B62,B65,B66,B68,B7,B70,B72,B74,B75,B76,B79,B8,B83,B86,B89,B93,B97,B98,B99,C10,C11,C15,C18,C19,C21,C23,C24,C26,C28,C31,C33,C35,C37,C38,C4,C40,C43,C45,C46,C48,C49,C50,C52,C54,C55,C56,C59,C60,C65,C66,C68,C69,C7,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C80,C81,C83,C85,C87,C9,D1,D10,D11,D3,D5,D6,D9
`Chr2:69295489`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A14,A16,A23,A5,A7,A8,B135,B37,B8,C78,C85
`Chr2:69295554`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B68,B96,C33
`Chr2:69295607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr2:69295620`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	A11,A22,B28,B45,B7,B80,B81,C13,C69,C7,C79,C8
`Chr2:69295665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:69295678`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	138	A10,A11,A14,A19,A2,A20,A21,A23,A24,A25,A3,A4,A9,B1,B100,B101,B102,B103,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B112,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B123,B125,B127,B128,B129,B13,B131,B132,B133,B134,B137,B14,B140,B17,B18,B19,B2,B20,B22,B23,B24,B25,B26,B28,B29,B3,B30,B32,B33,B34,B35,B40,B41,B42,B43,B45,B54,B6,B61,B63,B65,B67,B68,B7,B70,B71,B73,B75,B78,B80,B81,B84,B85,B86,B87,B89,B9,B93,B94,B95,C1,C10,C13,C16,C17,C18,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C30,C31,C33,C35,C36,C37,C39,C40,C42,C45,C46,C48,C5,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C64,C66,C67,C7,C73,C74,C76,C77,C80,C81,C85,C86,D2,D4,D5
`Chr2:69295741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr2:69295759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793314.1

132 aa

132

DUF1764

PF08576 DUF1764 28-132 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793314.1`	Pfam	`PF08576`	DUF1764	Family	28	132	5.7e-26	92.0	Eukaryotic protein of unknown function (DUF1764)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937331.1
ATGAAAAAAGTTGGTAAGTCGAAGAAGCAGCCAAAAGCAGAACACGAGAGTAACGTTGTGGAACAGGAGAAGGCCTCTGTCCGGCCAAAAAAGAATGCGAGTGAGATTGATGAAATCTTTGCTGGAAAGAAACGCAAGAGACTGGAAACGGAAAAGAAGGCCGAGGATGAGAAGCCTGCCAAAGTAGCAGCTGCAACTGTGAGGCCACTCGACAAAAAGAAGGGAAAGAGTATCAAGAGCCGCTCCTTCAAACAGAGTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009932
ATGAAAAAAGTTGGTAAGTCGAAGAAGCAGCCAAAAGCAGAACACGAGAGTAACGTTGTGGAACAGGAGAAGGCCTCTGTCCGGCCAAAAAAGAATGCGAGTGAGATTGATGAAATCTTTGCTGGAAAGAAACGCAAGAGACTGGAAACGGAAAAGAAGGCCGAGGATGAGAAGCCTGCCAAAGTAGCAGCTGCAACTGTGAGGCCACTCGACAAAAAGAAGGGAAAGAGTATCAAGAGCCGCTCCTTCAAACAGAGTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793314.1
MKKVGKSKKQPKAEHESNVVEQEKASVRPKKNASEIDEIFAGKKRKRLETEKKAEDEKPAKVAAATVRPLDKKKGKSIKSRSFKQSSSAVGYSQSRKKTADGLSVFSEEELGIGKPDAGGTALCPFDCDCCF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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