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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004702`

染色体: Chr02 坐标: 69329970-69333125 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004702`
名称	SmilChr02G004702
描述	probable carboxylesterase 11
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69329970 - 69333125 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008696`
GeneID	`131008696`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008696`
原始查询	`SmilChr02G004702`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable carboxylesterase 11
产物	probable carboxylesterase 11
Arabidopsis	`AT3G27320` (AT3G27320) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822351] identity=71.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0256000` - identity=58.9; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016787 (hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF07859 (Abhydrolase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008696

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057791688.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057791688.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057791688.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791688.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791688.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69330549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B110,C47,C53
`Chr2:69330561`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A15
`Chr2:69330561`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A15
`Chr2:69330621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr2:69330705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,B77,C23
`Chr2:69330902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B85
`Chr2:69330979`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr2:69331030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr2:69331092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:69331209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,C78
`Chr2:69331263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B36,B51,C51,C70,D8
`Chr2:69332271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,A4,B103,B127,B54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791688.1

464 aa

232

464

Abhydrolase_3

PF07859 Abhydrolase_3 172-429 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791688.1`	Pfam	`PF07859`	Abhydrolase_3	Domain	172	429	1.7e-55	188.8	alpha/beta hydrolase fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935705.1
TACTTCACTTGTACGTCCTGACTTTTCGTAAACCACCTCCTTGAGTACAACCGTCAAAAGCAGAAAAAGGTAATACTACCTGGTCCAATATACGGTCTACCTGGCACGAGACATTATTTTAATGCTACGAATTTAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAAAAGGAAAAACAGCGCAAACCTGCATCTCAATCTATCTCATCCTTTTTTTTTTTTTTTGATAATTACATCATTACTCTGCATTTCCCCAACACACTCTCTCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008696
ATGCCAAGTATTGGTGTGAAACTGTATAGCGTATTCTTCAAATTCATGCTGAAGCATCGTTTGCAGAGCCGATTGCAGGCTCCGGAAAACGATGCTGTCGGCGGCTCCGGCGGTACCTTTGGGGTGACGTCACGCCCGGCGGAGGAAACGGCGGCGGCTGCCAATCCCCTGTTCACTGATGGCGTCGCGACGAAGGATGTGCATATCGATCCCGTGACTTCGGTATCTGTTCGTGTTTTTCTTCCTGAAACCTGCCTTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791688.1
MPSIGVKLYSVFFKFMLKHRLQSRLQAPENDAVGGSGGTFGVTSRPAEETAAAANPLFTDGVATKDVHIDPVTSVSVRVFLPETCLNFPDAKSKSGVALLDQNRSLIRRYSHGSSDNSAVSGTNVVIVKNVDSSLRRSSYGCSVDDANLKSENGTYRGYNPVGRGSRRLPVMLQFHGGGFVSGSNDSVANDFFCRRIARLCDVIVLAVGYRLAPENKYPSAFEDGLKVLHWLAKQANLAECTKSLGSSKGAGVDLRRSEG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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