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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004709`

染色体: Chr02 坐标: 69362241-69363486 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004709`
名称	SmilChr02G004709
描述	protein NOI4-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69362241 - 69363486 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008761`
GeneID	`131008761`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008761`
原始查询	`SmilChr02G004709`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NOI4-like
产物	protein NOI4-like
Arabidopsis	`AT5G63270` (AT5G63270) RPM1-interacting protein 4 (RIN4) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836447] identity=55.8; qcov=0.917; evalue=3.35e-21; confidence=medium
Rice	`Os09g0253000` - identity=54.9; qcov=0.976; evalue=2.78e-21; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05627 (AvrRpt-cleavage)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008761

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057791779.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057791779.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791779.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791779.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791779.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69363147`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791779.1

84 aa

AvrRpt-cleavage

PF05627 AvrRpt-cleavage 6-40 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791779.1`	Pfam	`PF05627`	AvrRpt-cleavage	Domain	6	40	7.1e-19	67.6	Cleavage site for pathogenic type III effector avirulence factor Avr

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935796.1
AAATGGAGGGCCATTTATTATTGAGATGATTATCCAGTTAATAACGCTCGGCTTGTATTTAGGTTGCAGGCAAAATGTGTTAATTCCGTGTATTAAAATCATATACACCACACCCTCCATTTATATGTGTGTGTAGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCCCTCCTTCCTAAGGACTCGTTCTCTATTTTCATCACCAATCTCTCTCTCGCTCTGCCGTCTCTCTCTCCATTTTCATTTTTTCTGCAAATTCGGCACCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008761
ATGACGTCTAGCAGCGAAAAGGGTAAGCCGTTGCCTAAATTTGGTGAGTGGGACGTGAACAACCCAGCCTCGGCGGATGGATTTACGGTCATCTTCGCCAAGGCTAGGGATGAAAAGAAGGGCAAGAACTCCGGCGGCAGTACCGGCGGCTCCGTCCAGTCTAACAAGGAGCCGCCTCGCTCTCGATCACGCTCCTCCACCCAATCCACTCAATCATATGACCCTAACAAGAAAAAGTGGCTTTGCTGTTTCTGA

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791779.1
MTSSSEKGKPLPKFGEWDVNNPASADGFTVIFAKARDEKKGKNSGGSTGGSVQSNKEPPRSRSRSSTQSTQSYDPNKKKWLCCF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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