当前解析结果
SmilChr02G004714| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004714 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004714 |
| 描述 | isoaspartyl peptidase/L-asparaginase 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 69406368 - 69407424 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008720 |
|---|---|
| GeneID | 131008720 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008720 |
| 原始查询 | SmilChr02G004714 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | isoaspartyl peptidase/L-asparaginase 1-like |
| 产物 | isoaspartyl peptidase/L-asparaginase 1-like |
| Arabidopsis | AT5G08100 (ASPGA1)N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830704] identity=76.3; qcov=0.991; evalue=7.05e-176; confidence=high |
| Rice | Os03g0597600 (OsASNase1)- identity=71.3; qcov=1; evalue=4.54e-161; confidence=high |
| GO | GO:0016787 (hydrolase activity) |
| KEGG | smil00250 (Alanine, aspartate and glutamate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00460 (Cyanoamino acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF01112 (Asparaginase_2) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008720 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057791719.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057791719.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057791719.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057791719.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791719.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:69406461 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C70 |
Chr2:69406874 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B48 |
Chr2:69406951 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A24,B36,B51,C51 |
Chr2:69407108 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B86,C26,C84 |
Chr2:69407141 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B106,C75 |
Chr2:69407180 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A24,B140 |
Chr2:69407223 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B130,B20,C51 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057791719.1PF01112
Asparaginase_2 1-313 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057791719.1 |
Pfam | PF01112 |
Asparaginase_2 | Domain | 1 | 313 | 4.4e-117 | 391.4 | Asparaginase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。