Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004724`

染色体: Chr02 坐标: 69495507-69496912 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004724`
名称	SmilChr02G004724
描述	uncharacterized SmilChr02G004724
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69495507 - 69496912 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008748`
GeneID	`131008748`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008748`
原始查询	`SmilChr02G004724`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cryptic loci regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822374]; symbol=AT3G27520; hit=AT3G27520; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	cryptic loci regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822374]; symbol=AT3G27520; hit=AT3G27520; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G27520` (AT3G27520) cryptic loci regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822374] identity=42.8; qcov=1.06; evalue=2.86e-40; confidence=medium
Rice	`Os02g0595300` (OJ1126_D09.25) - identity=34.7; qcov=0.962; evalue=1.49e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008748

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791765.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057791765.1`
3	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057791765.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057791765.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791765.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69495881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B11,C19,D4
`Chr2:69496013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B104,B11,C19,D4
`Chr2:69496047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B122,B93,C2
`Chr2:69496070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr2:69496294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B36,B47,C56,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935782.1
TAATTCGATATGTCTCTATACTATAAATTCCTATTATTGAGGGACCAAACCTTGGTTTTCAGTAAAGGAAGGGGCGAAAATGAGAATATCCGACACTTTTAAGCTTCCACGAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAATTGATTTTCAAGGTTTAGCGGTCAAAAAATTTGCGATCTTTTGAAAAATTTCGTTGGCTCAATTTCCCTGCATTTACGAACCGAAAATTTCCGCTTGTAGCTATGGCCAGTGAAGCCGGCTGCCACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008748
ATGGCCAGTGAAGCCGGCTGCCACAATCCCGACGACTGGGAGCTCATAAACATCGACGGCTTCGTCTGCAAGCGCAAAAAGCGCCCCCGCCTCGAACCCGCCGTCGCCGCCCCTCCGCCGCCGGATCCGGAGGCTGAGCGGAAGCACCGCCTTGAGCGAAGGAAGAGGGCCCTGCTGAAGTTGAGGGAGAGGTATTTGGAAGAGATCAGCCGGTGGGAACTTTTGTCGAATACGTTGACGGCAATGGAGCAGAACGCTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791765.1
MASEAGCHNPDDWELINIDGFVCKRKKRPRLEPAVAAPPPPDPEAERKHRLERRKRALLKLRERYLEEISRWELLSNTLTAMEQNATTQSMERQELHPTTSSDGASSSGEPSAADSSRRRLVDDLLSQVEAQEAIIGCVSNLCDVAEGLCSAQEERLKQQLIDLPIWVPSPHELMAALGDDDQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器