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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004743`

染色体: Chr02 坐标: 69644540-69647992 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004743`
名称	SmilChr02G004743
描述	high affinity nitrate transporter 2.7
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69644540 - 69647992 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008695`
GeneID	`131008695`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008695`
原始查询	`SmilChr02G004743`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	high affinity nitrate transporter 2.7
产物	high affinity nitrate transporter 2.7
Arabidopsis	`AT5G14570` (NRT2.7) high affinity nitrate transporter 2.7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831308] identity=62.8; qcov=0.953; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0112600` (NRT2.1) - identity=51.7; qcov=0.955; evalue=8.34e-163; confidence=high
GO	GO:0015112 (nitrate transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	smil00910 (Nitrogen metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF07690 (MFS_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008695

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057791687.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057791687.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057791687.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791687.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791687.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69644900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr2:69644980`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D3
`Chr2:69644980`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D3
`Chr2:69646718`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr2:69646736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr2:69646746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B94,C48,C71
`Chr2:69646772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,C13,C45
`Chr2:69646778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr2:69646779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr2:69646882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr2:69647232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B115,C16,C45,D7
`Chr2:69647268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791687.1

468 aa

234

468

MFS_1

PF07690 MFS_1 43-267 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791687.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	43	267	6.7e-23	81.9	Major Facilitator Superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935704.1
GCTAGTAATAAGGTGACGAGTGATGAGAATATATATGGCAGGTGATCCTGAAGTGCAATTGCGACAACGCTATATAGTATATATACTTCCATATTGTGAAATGGTTTATATATAATATAGAGTTAACCTCTGGCATGCTATATTGGTGCTGCTATAATCGGAAAAACCAACAAATACTGATATACCCGTAGGCGGCGACGGCAGCCACGATGGATCTGCCTTCCAAAACCACCGCCGCCTTCCCCTACCCCCTCCCTGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008695
ATGGATCTGCCTTCCAAAACCACCGCCGCCTTCCCCTACCCCCTCCCTGTCGACTCCCTCCACCGCGCCACCCAATTCCGCCCATTCTCCCTCTCCGGCCCCCACATGCGCGCCTTCCATCTCGCCTGGCTCTCCCTCTTCTCCTGCTTCTTCTCCACCTTCGCCGTCCCGCCCCTCCTCCCCGCCATCCGCCGCGACGTCCTCCTCTCCGACGCCGACGTCGGCTCCGCCGGCATCGCCGCCTTCGCCGGCTCCATCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791687.1
MDLPSKTTAAFPYPLPVDSLHRATQFRPFSLSGPHMRAFHLAWLSLFSCFFSTFAVPPLLPAIRRDVLLSDADVGSAGIAAFAGSILSRLAMGPACDLFGPRAASAAISLVTAPAVLSLAFVSSPAAFIAARFFIGFSLANFVACQFWMSSMFSGNVVGVANGVSAGWANVGSGLTQLIMPLIYSFLTATAKISSSTAWRAAFVVPAALQVATALMVLAFGQDLPHGKYRRKQKSDSSGNSLMSVLFNGLKNYRGWILGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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