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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004749`

染色体: Chr02 坐标: 69690685-69693353 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004749`
名称	SmilChr02G004749
描述	peptide deformylase 1B, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69690685 - 69693353 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008737`
GeneID	`131008737`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008737`
原始查询	`SmilChr02G004749`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptide deformylase 1B, chloroplastic-like
产物	peptide deformylase 1B%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G14660` (PDF1B) peptide deformylase 1B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831318] identity=58.9; qcov=1.02; evalue=1.08e-109; confidence=high
Rice	`Os01g0637600` (OsPDF1B) - identity=61.2; qcov=0.808; evalue=8e-98; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0009507 (chloroplast); GO:0018206 (peptidyl-methionine modification); GO:0042586 (peptide deformylase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01327 (Pep_deformylase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008737

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057791751.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057791751.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791751.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791751.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791751.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69690843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr2:69690848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:69690851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B140,B93,C2,C47
`Chr2:69690875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B83
`Chr2:69690904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B83
`Chr2:69691169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,B36,B47,C56,C65
`Chr2:69691180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B83
`Chr2:69691181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,B81,B9
`Chr2:69691756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,C28,C35,C4
`Chr2:69691771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B32,B40,B80,C83
`Chr2:69691778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,B81,B9
`Chr2:69691789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791751.1

265 aa

132

265

Pep_deformylase

PF01327 Pep_deformylase 73-221 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791751.1`	Pfam	`PF01327`	Pep_deformylase	Domain	73	221	1.1e-51	175.2	Polypeptide deformylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935768.1
TAAATGAAACTTTTTTTCCTTTTCTTTTTTCGTGTAAACGGGATTATAAATTTTCAGATCCCAAATAATTGCCGTAATGGCTGCTCCGACATACCTCCACTCCACCGCCCTCACTCACACACTCCTCCCCTTCCTCCGCCCCCTATCCCGCCGTGCTGGTTCCTTCACCCCGTCTTCTCGCGGCCACAAGCTTGCGGTCCGACCAGTACTTGCGCAGGCACGGCGGAGCTCCTCTCCCGTAGCTAAAGTTGAACAAGTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008737
ATGGCTGCTCCGACATACCTCCACTCCACCGCCCTCACTCACACACTCCTCCCCTTCCTCCGCCCCCTATCCCGCCGTGCTGGTTCCTTCACCCCGTCTTCTCGCGGCCACAAGCTTGCGGTCCGACCAGTACTTGCGCAGGCACGGCGGAGCTCCTCTCCCGTAGCTAAAGTTGAACAAGTAGCTTCTCCCTCTGATTTGCTATTTAAGGGACCTCTTGAAATAATTAAGTATCCGGACCCCATTTTGAGAGCAAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791751.1
MAAPTYLHSTALTHTLLPFLRPLSRRAGSFTPSSRGHKLAVRPVLAQARRSSSPVAKVEQVASPSDLLFKGPLEIIKYPDPILRAKNKRVASFDENLKRLVDEMFDIMYITDGMGLSAPQVGINVQLMVFNPAGERGTGEEIVLVNPQIKRYSRKIVPFEEGCLSFPNIYADVKRPDSLKVDAQDVKGARFEMNLTGLVARVFQHEYDHLQGVLFFDRMGDEVLETIRAQLQALEKEYEKRTGLESPEKIEAREIRKKAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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