当前解析结果
SmilChr02G004750| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004750 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004750 |
| 描述 | sulfated surface glycoprotein 185-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 69693940 - 69694625 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131009937 |
|---|---|
| GeneID | 131009937 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009937 |
| 原始查询 | SmilChr02G004750 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | sulfated surface glycoprotein 185-like |
| 产物 | sulfated surface glycoprotein 185-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009937 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057793318.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057793318.1 |
| 3 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.20000 | XP_057793318.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793318.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793318.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:69693989 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr2:69694081 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B23 |
Chr2:69694092 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A21,B98,C20,C21,C49 |
Chr2:69694134 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B40,B43,C54 |
Chr2:69694158 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr2:69694162 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B125,D3 |
Chr2:69694163 |
TGC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 36 | A1,A14,A19,A24,B103,B11,B117,B12,B123,B133,B16,B23,B29,B35,B40,B42,B44,B49,B50,B55,B73,B82,B94,C1,C22,C29,C31,C32,C50,C52,C56,C58,C59,C66,C81,C9 |
Chr2:69694202 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A18,B26 |
Chr2:69694215 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr2:69694218 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A13,B14,B20,B30,C37 |
Chr2:69694220 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B66,B79,B90,C32,D5 |
Chr2:69694257 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,B86 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。