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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004756`

染色体: Chr02 坐标: 69738659-69740822 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004756`
名称	SmilChr02G004756
描述	universal stress protein A-like protein
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69738659 - 69740822 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008749`
GeneID	`131008749`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008749`
原始查询	`SmilChr02G004756`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	universal stress protein A-like protein
产物	universal stress protein A-like protein
Arabidopsis	`AT5G14680` (AT5G14680) Adenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831320] identity=75.1; qcov=0.966; evalue=8.5e-102; confidence=high
Rice	`Os02g0707900` (OSJNBb0060O16.22) - identity=75; qcov=0.983; evalue=2.53e-101; confidence=high
GO	GO:0016208 (AMP binding)
KEGG	-
Pfam	PF00582 (Usp)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008749

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057791766.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057791766.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057791766.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057791766.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791766.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69739065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,C1,D7
`Chr2:69739341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr2:69739595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr2:69740580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,C28,C43,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791766.1

179 aa

179

Usp

PF00582 Usp 27-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791766.1`	Pfam	`PF00582`	Usp	Domain	27	166	5e-16	60.2	Universal stress protein family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935783.1
AATTTGTGAATTCGAGAGAAGGAAGTACTAGGAATAAAATAGAGCAACCGACGTTAATTTGTAAATGTAGAGTAGTCCACACTCTTTTCTGCAGCAGTGTGAGTTGTGAGCGAGAGATGGCAGCAGCGGAGGGCGCTGCGCCGACTCGGATAATGGTGGCGGTGAACGAATCAACTATCAAAGGTTATCCCCACGCTTCCATAAGCAGCACTGGAGCTTTCCACTGGACTCTCAACAAAATCGTTCGCACCAACACCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008749
ATGGCAGCAGCGGAGGGCGCTGCGCCGACTCGGATAATGGTGGCGGTGAACGAATCAACTATCAAAGGTTATCCCCACGCTTCCATAAGCAGCACTGGAGCTTTCCACTGGACTCTCAACAAAATCGTTCGCACCAACACCTCTGCTTTCAAGCTTCTGTTTCTTCACGTTCAAGTCCCTGACGAAGACGGTTTTGATGATATGGATAGCATATTTGCCTCCCCTGAAGATTTCAGGACGATGAAGCGTAGAGACAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791766.1
MAAAEGAAPTRIMVAVNESTIKGYPHASISSTGAFHWTLNKIVRTNTSAFKLLFLHVQVPDEDGFDDMDSIFASPEDFRTMKRRDKIRGLHLLEYFVNHCHEIGVACEAWIKIGDAKEVICHEANRIQPDFLVLGSRGLGPFQRVFVGTVSEFCVKHADCPVIAIKRNASQTPQDPVDD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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