当前解析结果
SmilChr02G004762| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004762 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004762 |
| 描述 | uncharacterized protein At4g28440-like |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 69800732 - 69803068 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008757 |
|---|---|
| GeneID | 131008757 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008757 |
| 原始查询 | SmilChr02G004762 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838985]; symbol=AT1G23750; hit=AT1G23750; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838985]; symbol=AT1G23750; hit=AT1G23750; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT1G23750 (AT1G23750)Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838985] identity=71.4; qcov=0.964; evalue=4.24e-71; confidence=high |
| Rice | Os05g0100800- identity=73.6; qcov=0.935; evalue=1.7e-66; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF21473 (OB_Ssb-like) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008757 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057791774.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057791774.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057791774.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057791774.1 |
| 5 | Nuclear body | 核内小体 | 0.40000 | XP_057791774.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:69801417 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B21,B7 |
Chr2:69802565 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B69 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057791774.1PF21473
OB_Ssb-like 19-109 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057791774.1 |
Pfam | PF21473 |
OB_Ssb-like | Domain | 19 | 109 | 7e-46 | 155.0 | Single-stranded DNA binding protein Ssb-like, OB fold |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。