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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004769`

染色体: Chr02 坐标: 69863351-69865064 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004769`
名称	SmilChr02G004769
描述	uncharacterized SmilChr02G004769
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69863351 - 69865064 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008746`
GeneID	`131008746`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008746`
原始查询	`SmilChr02G004769`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA ligase/cyclic nucleotide phosphodiesterase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834017]; symbol=AT5G40190; hit=AT5G40190; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RNA ligase/cyclic nucleotide phosphodiesterase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834017]; symbol=AT5G40190; hit=AT5G40190; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G40190` (AT5G40190) RNA ligase/cyclic nucleotide phosphodiesterase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834017] identity=68.7; qcov=0.968; evalue=2.4e-85; confidence=high
Rice	`Os09g0375400` - identity=56; qcov=0.984; evalue=2.38e-58; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13563 (2_5_RNA_ligase2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008746

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057791763.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057791763.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791763.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791763.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791763.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69864245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B7,D3
`Chr2:69864371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr2:69864446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791763.1

185 aa

185

2_5_RNA_ligase2

PF13563 2_5_RNA_ligase2 40-167 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791763.1`	Pfam	`PF13563`	2_5_RNA_ligase2	Family	40	167	4.5e-16	60.0	2'-5' RNA ligase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935780.1
GTATTTGAAAAACAAGAAATTATTTGTTACAAAAAAGAAGGAAAAGAAAGTGAATTAATGTATAGGGTATTCTTCAAGGAAATCACTTTCTTTGTGAAGGCCCTCTTTTCCTCAACTCTTTATTCCCCTGTCTAAATCTCAATCAAACCTTTAACATCTTAACAGACTGTTTTTCACATGCTCTCTCTCTCTCTAACATCAACTTTTCACTTGTATTACTTTCTCCAGAATTTCATTTTCTCCGGTTTCATCTCTGCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008746
ATGTCGCAAAGCTATGCCGTTGAGCTTTACTTCGATCCTGCGCTTGAGAATCAGGTATTGAAGGCCTGGAATGTACTGGCTCGACGCCAAATCAGCACACAGCTGATTGAGATTGAATCAAGGCCTCACCTGACCTTATTTTGGAGTGATTTTGTTGATGTTGCTAAGTTAGAGAATGTACTAAGAATCATTGGTTCGAAGCAAGAACCTCTGTCTCTGTCTTTCTCTTCAATTGGAAGCCTCCCAAGTGACAACAACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791763.1
MSQSYAVELYFDPALENQVLKAWNVLARRQISTQLIEIESRPHLTLFWSDFVDVAKLENVLRIIGSKQEPLSLSFSSIGSLPSDNNVLFLGPTPSASLLQFHSQLCDAMKKDGIEIGEEYRPDKWIPHCLVAQEVPKARMAEAFTVLRDLKLPVSGYATEISLVEYQPVRELFSLTLGTHYLSEG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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