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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004771`

染色体: Chr02 坐标: 69880677-69888132 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004771`
名称	SmilChr02G004771
描述	uncharacterized SmilChr02G004771
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69880677 - 69888132 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008739`
GeneID	`131008739`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008739`
原始查询	`SmilChr02G004771`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Thioredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831274]; symbol=AT5G14240; hit=AT5G14240; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Thioredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831274]; symbol=AT5G14240; hit=AT5G14240; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G14240` (AT5G14240) Thioredoxin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831274] identity=73.3; qcov=0.996; evalue=4.46e-124; confidence=high
Rice	`Os01g0184800` - identity=72.1; qcov=0.968; evalue=1.73e-113; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006457 (protein folding)
KEGG	-
Pfam	PF02114 (Phosducin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008739

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791753.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057791753.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791753.1`
4	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057791753.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791753.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69881041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr2:69881739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B37,C49
`Chr2:69881905`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A22,B36,C1,C29,C41,C86
`Chr2:69881932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C21
`Chr2:69881958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:69882035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr2:69882799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C21
`Chr2:69882856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B20,C61,C66,C74
`Chr2:69882883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B37,C49,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791753.1

248 aa

124

248

Phosducin

PF02114 Phosducin 55-180 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791753.1`	Pfam	`PF02114`	Phosducin	Domain	55	180	8.7e-16	58.4	Phosducin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935770.1
CTTTGGTCCCCTCCCCCCATTCACGCGGTCCGCTCCAAACCAGACGGCAGACACCACCGCTCCACGCAGCCGGCGCCTCCACTCGCGGCGAGCACGTCCGCCAGCTGCCCACGACGCAGCCGGCGCCTCCACTTCTACATGCCCATTTATATAATCTAGATTAACACTGTTATTTTATACTATTATTATAGATTATAGATGATAAATGTTCTGAAAAACGGTGAGGGAATAAAGTGAGCGGGGAGTTGCGAAGATCCACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008739
ATGGCGGATTACCATTTTGTGTACAAGGATTTGGAAGGGGCTTCCACGCAATGGGACGATATTCAGAGGAAACTCGGAAATCTACCGGAGAAGGCACCGGTATTCAAGCCGCCGTCTTTCACCCCGGCCGAGGACGAGGATTCCAAGCCCAAGAATAGGACCTGGATCGATGGCAAAACTGAGGAGGAGCTTGAAGATCTCGAAGATGATCTCGACGATGATCGCTTCCTCGAGGAGTACAGGAAGAAAAGGTTGGTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791753.1
MADYHFVYKDLEGASTQWDDIQRKLGNLPEKAPVFKPPSFTPAEDEDSKPKNRTWIDGKTEEELEDLEDDLDDDRFLEEYRKKRLVEMREAAKIAKFGSVIPISGSDFVREVSQAPQDVWVVVLLYKDGFPECRVLLQCLEDLAKRYPATKFVKIISTECIPNYPDRNLPTILVYNNSAVKATHVGIHSFGRRCTSESVALVLCQSDPVLNDGHGGEQSRDAVLDGVRKKFLERVVREREDDDGSSSD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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