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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004779`

染色体: Chr02 坐标: 69960743-69964307 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004779`
名称	SmilChr02G004779
描述	rhamnogalacturonan I rhamnosyltransferase 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	69960743 - 69964307 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008689`
GeneID	`131008689`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008689`
原始查询	`SmilChr02G004779`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rhamnogalacturonan I rhamnosyltransferase 1-like
产物	rhamnogalacturonan I rhamnosyltransferase 1-like
Arabidopsis	`AT3G02250` (AT3G02250) O-fucosyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821223] identity=71.1; qcov=0.957; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0284200` - identity=74.2; qcov=0.961; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF10250 (O-FucT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008689

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057791666.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057791666.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791666.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791666.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791666.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:69961172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B64,C64,C66
`Chr2:69961182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B55
`Chr2:69961189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr2:69961218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B55
`Chr2:69961239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr2:69961248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:69961561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B55
`Chr2:69961580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,C73
`Chr2:69961895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:69962485`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,C73
`Chr2:69962729`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:69963430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791666.1

517 aa

258

517

O-FucT

PF10250 O-FucT 114-433 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791666.1`	Pfam	`PF10250`	O-FucT	Family	114	433	7e-108	362.0	GDP-fucose protein O-fucosyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935683.1
ACAACATTTCCCTTTCCTCTGATTTACACCCCACACACACACTCTCTCTCCCTCCCTCATTTTCTCTCTCTCATACACACACTTACATATCCCACAAACCGACACCCTTCTTATCTCCCTCTCAATATCCCTCGCTGGGAGCTTACCTTCAGATGCCGCAACACCTTCAACCTCCATTGCGATTTCTCCTTTTTAAAACCTTGGACTTGTCACAATTTTCCTTTTAATATTTCTCGATCTATTGCTGGAGATCGACCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008689
ATGTGCAGATTAAAGGATTGCGAGGAGAGCAACCGAAGGAGAAAGTGGGGGATAATGGGGCTCAAAACGGCGGCGTTCGGGGGCGACAGATTGGAGAAGCTGAGGAATAGCGGCGTCGTATCGCGATCGAGAATGAAGCTTTGGATAATTAGAGCGACTACGTCGATTTTGCTGTGGACTTGCTTAGTTCAGTTGACGGCATTGAGCGAAACTCGGGGGCTTCGTGTTTTAAAGGGCTGGCCCTCTTGCTTCTCGCAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791666.1
MCRLKDCEESNRRRKWGIMGLKTAAFGGDRLEKLRNSGVVSRSRMKLWIIRATTSILLWTCLVQLTALSETRGLRVLKGWPSCFSQESAAVALDVHSHLARVLPPKRVYKNNGYLMVSCNGGLNQMRAAICDMVAIARHLNVTLVVPELDKTSFWNDPSEFQDIFDVDHFITSLRDEVRILKELPPRVKRRVELGIIYTMPPVSWSDISYYHNQILPLIQKYKVVHLNRTDARLANNDQPMDIQRLRCRVNFNALRFTPQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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