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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004792`

染色体: Chr02 坐标: 70114528-70116270 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004792`
名称	SmilChr02G004792
描述	uncharacterized SmilChr02G004792
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70114528 - 70116270 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008783`
GeneID	`131008783`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008783`
原始查询	`SmilChr02G004792`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818675]; symbol=AT2G40780; hit=AT2G40780; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818675]; symbol=AT2G40780; hit=AT2G40780; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G40780` (AT2G40780) Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818675] identity=51.4; qcov=0.978; evalue=1.96e-58; confidence=high
Rice	`Os03g0114200` (OSJNBa0090O10.11) - identity=54.6; qcov=0.972; evalue=9.63e-54; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006413 (translational initiation)
KEGG	-
Pfam	PF01176 (eIF-1a)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008783

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791792.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057791792.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.60000	`XP_057791792.1`
4	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057791792.1`
5	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.20000	`XP_057791792.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70114755`	`TCA`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B21,B35,B79,C44
`Chr2:70114758`	`TC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B125,B52
`Chr2:70114953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr2:70115236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B10,C62,D1
`Chr2:70115263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791792.1

179 aa

179

eIF-1a

PF01176 eIF-1a 18-113 aa

XP_057791793.1

179 aa

179

eIF-1a

PF01176 eIF-1a 18-113 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791792.1`	Pfam	`PF01176`	eIF-1a	Domain	18	113	3.3e-20	72.1	Translation initiation factor 1A / IF-1
`XP_057791793.1`	Pfam	`PF01176`	eIF-1a	Domain	18	113	3.3e-20	72.1	Translation initiation factor 1A / IF-1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935809.1
TCAACTCAAATTAAATGCTCCGTCTCTCACTGTCCCACAGCCCTCAGCCGCCGCCCGCTGTCGCTCTTCCGGCGTCACCGTCACAGCACACGGCAGCACCCAGACGGCTATCCGCTATCAACGACGAGGAGTGTTTTTCTGCCGCCGACTACAAGCCAGCTGTCCGGCGTCCGCCGCCGCTCCGCCACCCTTAGGCGCTTTGGACGGAGGGATACGCACGGCTCTCGCTCCTCTTCGCCAGTCATCTGCAGCTCGGCTCG...

XM_057935810.1
GTCTCTCACTGTCCCACAGCCCTCAGCCGCCGCCCGCTGTCGCTCTTCCGGCGTCACCGTCACAGCACACGGCAGCACCCAGACGGCTATCCGCTATCAACGACGAGGAGTGTTTTTCTGCCGCCGACTACAAGCCAGCTGTCCGGCGTCCGCCGCCGCTCCGCCACCCTTAGGCGCTTTGGACGGAGGGATACGCACGGCTCTCGCTCCTCTTCGCCAGTCATCTGCAGCTCGGCTCGCAATCGACGGGAACGACGTCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131008783
ATGAAAGGAGGAAGGAAGAATCTGAAGAGGGCGGTGGAGGCAGAGATGATGGCGCTCCAACAAGGCCAAAACATAATGCAGGTTGTCGATTTGAGGGGCTCTAATCTTATTGAGGTAATGGATGCAAAAGGACAACATCTACTAGCAATATTTCCAGCCAAATTCCAGAAAAGTATGTGGATTAAACGAGGCAACTTCGTAGTTGTAGATGAAAGTGGGAGAGAGGAGGCCATCGAATCTGGTAGAAAGGTGGCCGGCAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057791792.1
MKGGRKNLKRAVEAEMMALQQGQNIMQVVDLRGSNLIEVMDAKGQHLLAIFPAKFQKSMWIKRGNFVVVDESGREEAIESGRKVAGILTQVLYHDQVRLLRKASQWPDIFKSETSTQSLHLPASKENDECLKDDECSSDDDDDDEGLPPLEANTNRVNPLLLHLDAESSASDSDIENDS

XP_057791793.1
MKGGRKNLKRAVEAEMMALQQGQNIMQVVDLRGSNLIEVMDAKGQHLLAIFPAKFQKSMWIKRGNFVVVDESGREEAIESGRKVAGILTQVLYHDQVRLLRKASQWPDIFKSETSTQSLHLPASKENDECLKDDECSSDDDDDDEGLPPLEANTNRVNPLLLHLDAESSASDSDIENDS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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