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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004793`

染色体: Chr02 坐标: 70129818-70131629 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004793`
名称	SmilChr02G004793
描述	transcription factor TCP17-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70129818 - 70131629 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008785`
GeneID	`131008785`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008785`
原始查询	`SmilChr02G004793`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor TCP17-like
产物	transcription factor TCP17-like
Arabidopsis	`AT5G60970` (TCP5) TEOSINTE BRANCHED 1, cycloidea and PCF transcription factor 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836218] identity=48.2; qcov=0.659; evalue=1.01e-44; confidence=medium
Rice	`Os05g0513100` (OsTCP18) - identity=75; qcov=0.287; evalue=2.25e-37; confidence=weak
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03634 (TCP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008785

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791795.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791795.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791795.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791795.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791795.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70130265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B114,C34
`Chr2:70130283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr2:70130303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,B8,C15,C26,C37
`Chr2:70130367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr2:70130564`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B26,B67,B8,C15,C37,C76,C85
`Chr2:70130567`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B26,B67,B8,C15,C37,C76,C85
`Chr2:70130962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791795.1

293 aa

146

293

TCP

PF03634 TCP 40-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791795.1`	Pfam	`PF03634`	TCP	Family	40	146	3.9e-26	93.2	TCP family transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935812.1
TTACCAGATTTTTGATATGTGTCGTTATGCACCGACGACACATGGTCGCAATTGCGCCATACCTTTATCTTTTCTGCAACATGGAGTGGTAAAATATTCCATCACCATCATCATCTCCCTCCCTCTCTTCCCTAAATCCCAACCAAATTATTTCCTTCTTTCATCAACACATAGGGTTTTCTTTCCTCTTCTAGAATGGGCTGATCACACAGAATCTTCAACACATATCTTCTAAGCAGAAATCCAGTTTCTTGATCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008785
ATGAATTCTAGAGAGAGAGTGAAGCAAGAAGGGTCGCCGAAGCTCCCTCCGGCGAGATCACAGTGGTCGTCGAGCCACAAAAACCCCCGAATAGTGCGCGTGTCACGCAGCTTCGGGGGCAAAGACCGGCACAGCAAAGTGTGCACGGTGAGGGGGCTGAGAGACCGGCGCATTCGGCTCTCCATCCCCACGGCGGTGCAGCTCTACGACCTCCAAGAGAAGCTCGGCCTCAGCCAGCCGAGCAAGGTCGTCGACTGGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791795.1
MNSRERVKQEGSPKLPPARSQWSSSHKNPRIVRVSRSFGGKDRHSKVCTVRGLRDRRIRLSIPTAVQLYDLQEKLGLSQPSKVVDWLLDATKADIDKLPPLPIIPGIFSPNPNQDSPSSSLSQFLASKQAMIKTHDDERERESTQKWIQDQNHDEEGFGGFVAQNFFPLGNVVNHQSHFPNFHHNPYFHWDHPNLSLSHQFGPNYNPPLPNQGQGADQINPNPNSHLYFYPNTAPTIPPFPSYLPPSMENVQQNLGFSTA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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