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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004795`

染色体: Chr02 坐标: 70146692-70147455 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004795`
名称	SmilChr02G004795
描述	psbQ-like protein 3, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70146692 - 70147455 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008788`
GeneID	`131008788`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008788`
原始查询	`SmilChr02G004795`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	psbQ-like protein 3, chloroplastic
产物	psbQ-like protein 3%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G01918` (PQL3) PsbQ-like 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768499] identity=34.8; qcov=1.02; evalue=5.87e-28; confidence=low
Rice	`Os04g0523000` - identity=56.9; qcov=0.644; evalue=5.04e-42; confidence=medium
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009523 (photosystem II); GO:0009654 (photosystem II oxygen evolving complex); GO:0009767 (photosynthetic electron transport chain); GO:0015979 (photosynthesis); GO:0019898 (extrinsic component of membrane); GO:0045156 (GO:0045156)
KEGG	-
Pfam	PF05757 (PsbQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008788

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057791798.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057791798.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057791798.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057791798.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791798.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70146985`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr2:70146991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B103,B54,C16
`Chr2:70147072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:70147076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791798.1

180 aa

180

PsbQ

PF05757 PsbQ 9-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791798.1`	Pfam	`PF05757`	PsbQ	Family	9	177	9.3e-20	72.3	Oxygen evolving enhancer protein 3

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935815.1
AAAATACTAATAAAAAATATAGGAGTGTTTAGTAGGAGTAACTTTTATGACTATAATTGATTTTTATTTAAATAAAATGACTATTTTAAATATATACCTGTATAAGAATATAAAAATAACAAAATCACATAGGCGTTTTGTTATTTCTAACAATTGACCTTTAAAAATATATAGAAGATCAAAATGAATAAAAAATCCTGAGCAATGAACGCTTTGAAATTCCCTCAAAACCAAATGGCAGCAGCAGCTGCAGCTCCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008788
ATGAACGCTTTGAAATTCCCTCAAAACCAAATGGCAGCAGCAGCTGCAGCTCCAGCTCCATCATCCTTCCTCCACACACTCCATCCCCTCACCAAACCCTCCTCCACCACCGCCGCGACAAGACGGTCATCCATACTACTCACATCCGTCCTCCTCTGGACGCAGCACACAAAATCCGCCGCCGCATTCGATTTCCGGCTGACGGTGCCGGACCAGACCGTGGAAGAAGCGGAGTCCGGGATCCGGTCCCACGCGCAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791798.1
MNALKFPQNQMAAAAAAPAPSSFLHTLHPLTKPSSTTAATRRSSILLTSVLLWTQHTKSAAAFDFRLTVPDQTVEEAESGIRSHAQSLIGVKDLLAAESWREAQKLLRRSSALLKQDVYTMIQASASAERPRLRKLYADLFNAVTRLDYAARDKDRIRVWESYRTILLSLDDILSALFNK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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