当前解析结果
SmilChr02G004803| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004803 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004803 |
| 描述 | protein SPIRAL1-like 1 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 70213853 - 70216172 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008793 |
|---|---|
| GeneID | 131008793 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008793 |
| 原始查询 | SmilChr02G004803 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein SPIRAL1-like 1 |
| 产物 | protein SPIRAL1-like 1 |
| Arabidopsis | AT1G26355 (SP1L1)SPIRAL1-like1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6240366] identity=65.3; qcov=0.992; evalue=1.58e-39; confidence=medium |
| Rice | Os03g0417800- identity=92.6; qcov=0.443; evalue=4.65e-30; confidence=low |
| GO | GO:0010005 (cortical microtubule, transverse to long axis); GO:0043622 (cortical microtubule organization) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008793 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 0.80000 | XP_057791809.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057791809.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057791809.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057791809.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791809.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:70215048 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。