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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004807`

染色体: Chr02 坐标: 70236589-70240300 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004807`
名称	SmilChr02G004807
描述	RHOMBOID-like protein 12, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70236589 - 70240300 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008797`
GeneID	`131008797`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008797`
原始查询	`SmilChr02G004807`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RHOMBOID-like protein 12, mitochondrial
产物	RHOMBOID-like protein 12%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT1G18600` (RBL12) RHOMBOID-like protein 12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838441] identity=45.7; qcov=0.672; evalue=1.46e-50; confidence=medium
Rice	`Os01g0763100` (OsRhmbd4) - identity=40.3; qcov=0.769; evalue=6.77e-43; confidence=medium
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01694 (Rhomboid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008797

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057791826.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057791826.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057791826.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791826.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791826.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70236849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B133,B81,D3
`Chr2:70237993`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B130
`Chr2:70237993`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B130
`Chr2:70238030`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,B95,C14,C85
`Chr2:70238050`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr2:70238218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr2:70238306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C60
`Chr2:70238402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr2:70238411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr2:70240069`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B57
`Chr2:70240069`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B57
`Chr2:70240124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791826.1

329 aa

164

329

Rhomboid

PF01694 Rhomboid 160-317 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791826.1`	Pfam	`PF01694`	Rhomboid	Domain	160	317	2e-16	61.2	Rhomboid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935843.1
GAGTGAGTAATAATTTATCAATATTTTGGGTTTTTTCTAAGAGAGAATCAAGAGAGTGAAAAATGCGAAGGCAGCTGGGCGTGGGGCTGCTAACTAAAATCGCAAGAAATGGCCCTTCGATCAACGTAATATCGCCAAAATCTGCGTCTCCCTCCTCATTCCTCATCCCATTTCATCGTCGCTCTCTCTCCGAGTATTCCACGCTTTCACGTTCCCATTTATGGAAACTATGCTGTCCCAATGGCCTTAGAGGGACAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008797
ATGCGAAGGCAGCTGGGCGTGGGGCTGCTAACTAAAATCGCAAGAAATGGCCCTTCGATCAACGTAATATCGCCAAAATCTGCGTCTCCCTCCTCATTCCTCATCCCATTTCATCGTCGCTCTCTCTCCGAGTATTCCACGCTTTCACGTTCCCATTTATGGAAACTATGCTGTCCCAATGGCCTTAGAGGGACAATCCGAAATGGAGCTTTTCCCCCTTCACTTCTCGCAACAAGGGTTTTTTCCAACGCCCTTTTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791826.1
MRRQLGVGLLTKIARNGPSINVISPKSASPSSFLIPFHRRSLSEYSTLSRSHLWKLCCPNGLRGTIRNGAFPPSLLATRVFSNALLQGRPKFPVTFRNRRSLASFSLDRRRRSIFRRFIPDRCVVLLIVTNVLVYLLWRLAHPKFMVINFMVSADHIQHGMFHTLITSAFSHIKTDHLISNMLLLSIFGTRIARKFGPLYLLKLYLGGAIAGSMFFVVYQAFLAPSVKVKRPAISPLEFPGLGANAAVNAIVLLDIFLFP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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