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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004810`

染色体: Chr02 坐标: 70266135-70268242 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004810`
名称	SmilChr02G004810
描述	COBRA-like protein 4
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70266135 - 70268242 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008801`
GeneID	`131008801`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008801`
原始查询	`SmilChr02G004810`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	COBRA-like protein 4
产物	COBRA-like protein 4
Arabidopsis	`AT5G15630` (IRX6) COBRA-like extracellular glycosyl-phosphatidyl inositol-anchored protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831417] identity=78.6; qcov=0.947; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0416200` (BC1) - identity=70.5; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0010215 (cellulose microfibril organization); GO:0052324 (plant-type cell wall cellulose biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF04833 (COBRA_N); PF25079 (COB_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008801

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057791832.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791832.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791832.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791832.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791832.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70266315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr2:70266433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B134,B31,C39,D11
`Chr2:70266505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr2:70266726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B125,B25
`Chr2:70266864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B134,B31
`Chr2:70267023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:70267119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr2:70267247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,D10
`Chr2:70267280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr2:70267281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr2:70267313`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B95
`Chr2:70267313`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B95

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791832.1

435 aa

218

435

COBRA_N

COB_C

PF04833 COBRA_N 48-211 aa PF25079 COB_C 220-409 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791832.1`	Pfam	`PF04833`	COBRA_N	Domain	48	211	1.8e-66	223.9	COBRA N-terminal domain
`XP_057791832.1`	Pfam	`PF25079`	COB_C	Domain	220	409	1.4e-55	189.3	COBRA family C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935849.1
AAGAAGATGTAGCACCACTAAGACGTGACTGAAAGTGTTTTTAAGTTCAAGTGTCTCATCTCTCCCGCCTATTTTCCACAGCCAATTATATATCAAACTAATAATCAAATGAAATTCCAACAACTATTAGGTGTGAGATGAAATCATTGGGCATACCAATTCATCATCGCACACAACAACATAACTCCCAATCTTCATATAATCACCCAATCTGCACTACTTAGAACTACTTGTAATAGCAAAAAAATATATAAAAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008801
ATGAATCAGAAAATATTGAAGTTCACCTTATGGGCTATCTTGCTATCCATGATCTTTTCTCATGCTGCGTCGTACGACCCGTTGGATCCATTTGGGAACGTAACAATCAAATGGGACGTCATATCTTGGACTGCCGATGGATACGTGGCATTAGTGACGATGTTCAACTTCCAAATGTATCGACACATGATGAGCCCCGGGTGGACGCTGACGTGGGGTTGGGCGAAGAAGGAGGTGATATGGTCCATGGTGGGTGCCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791832.1
MNQKILKFTLWAILLSMIFSHAASYDPLDPFGNVTIKWDVISWTADGYVALVTMFNFQMYRHMMSPGWTLTWGWAKKEVIWSMVGAQTTEQGDCSKFKGNVPHCCKRNPTVVDLLPGVPYNQQIANCCKGGVVASWGQDPASAVSAFQVSVGLSGTTNKTVKLPTNFTLLGPGPGYTCGPAKIVPSTVYLTPDRRRKTQALMTWNVTCTYSQLLVSRHPSCCVSLSSFYNETITPCSKCACGCHNKKECIKPDSNKLKMV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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