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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004814`

染色体: Chr02 坐标: 70290289-70291919 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004814`
名称	SmilChr02G004814
描述	B3 domain-containing protein REM5-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70290289 - 70291919 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008805`
GeneID	`131008805`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008805`
原始查询	`SmilChr02G004814`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B3 domain-containing protein REM5-like
产物	B3 domain-containing protein REM5-like
Arabidopsis	`AT4G31640` (AT4G31640) transcriptional factor B3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829292] identity=27.9; qcov=0.909; evalue=3.4e-21; confidence=low
Rice	`Os03g0212300` - identity=26.2; qcov=0.925; evalue=4.41e-14; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008805

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791836.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791836.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791836.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791836.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791836.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70290435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr2:70290640`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	187	A10,A11,A13,A14,A15,A18,A19,A2,A21,A22,A23,A25,A3,A5,A6,A7,A8,A9,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B106,B107,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B115,B117,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B133,B135,B136,B138,B139,B14,B16,B17,B18,B19,B2,B21,B22,B23,B25,B26,B27,B28,B3,B30,B31,B32,B33,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B41,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B52,B53,B56,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B75,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B83,B85,B86,B88,B9,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C12,C14,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C24,C25,C26,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C46,C48,C49,C50,C51,C54,C55,C57,C58,C59,C6,C60,C63,C64,C66,C7,C71,C74,C75,C76,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C84,C85,C86,C87,D1,D3,D7,D8,D9
`Chr2:70290943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B64,B94,C58,C60
`Chr2:70290980`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A11,A21,B130,B67,C12,C75,C85
`Chr2:70291157`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C86
`Chr2:70291157`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C86
`Chr2:70291202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr2:70291270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B122
`Chr2:70291406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B122
`Chr2:70291652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B23,B28,B66
`Chr2:70291671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791836.1

261 aa

130

261

PF02362 B3 13-102 aa PF02362 B3 159-244 aa

XP_057791837.1

257 aa

128

257

PF02362 B3 13-102 aa PF02362 B3 155-240 aa

XP_057791838.1

254 aa

127

254

PF02362 B3 13-102 aa PF02362 B3 152-237 aa

XP_057791839.1

252 aa

126

252

PF02362 B3 13-102 aa PF02362 B3 150-235 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791836.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	13	102	6e-27	94.2	B3 DNA binding domain
`XP_057791836.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	159	244	6e-27	94.2	B3 DNA binding domain
`XP_057791837.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	13	102	5.7e-27	94.3	B3 DNA binding domain
`XP_057791837.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	155	240	5.7e-27	94.3	B3 DNA binding domain
`XP_057791838.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	13	102	5.4e-27	94.4	B3 DNA binding domain
`XP_057791838.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	152	237	5.4e-27	94.4	B3 DNA binding domain
`XP_057791839.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	13	102	5.3e-27	94.4	B3 DNA binding domain
`XP_057791839.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	150	235	5.3e-27	94.4	B3 DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935853.1
TGACATTATGCACTCAATCCCCGTTGATTAATTAACGCTACATTAAAAAAAAAAAAGCTTCAATTCATGAATCAATAGCAACAATTACGTACGTACTTATTTGGCCTTTTAACTCTCTCTCTTATCCACACTTGTCTATTTAAATTAGAAACCTCCCAGCTTCGTTAAACCCCTTTCGCTTTAGCTTCTCATTAAAATTTATTCAATTAATCAATGGAAGGAAAACATGGGCGCTCAATTACAAAGGACTTTTTCAAAGT...

XM_057935855.1
ACATTATGCACTCAATCCCCGTTGATTAATTAACGCTACATTAAAAAAAAAAAAGCTTCAATTCATGAATCAATAGCAACAATTACGTACGTACTTATTTGGCCTTTTAACTCTCTCTCTTATCCACACTTGTCTATTTAAATTAGAAACCTCCCAGCTTCGTTAAACCCCTTTCGCTTTAGCTTCTCATTAAAATTTATTCAATTAATCAATGGAAGGAAAACATGGGCGCTCAATTACAAAGGACTTTTTCAAAGTTT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131008805
ATGGAAGGAAAACATGGGCGCTCAATTACAAAGGACTTTTTCAAAGTTTTGATGCCTGGTTTCCACCAAAAATTGAGCCTGCCACCAATTGTTTCCAAGGAGCTAGAAAAGCAGAAATCGAGAAGAGTGATTCTAGAAAGCAGAATCGGAAAATGGAGAGTGAGTTTGTGCAGAAACCACGAAAATGGGTTGATCTGTTTGAATCAAGGATGGCCTCAATTTGTGGATCGCCACGCCTTAAAACTGGGCGAGTTCGTCGT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057791836.1
MEGKHGRSITKDFFKVLMPGFHQKLSLPPIVSKELEKQKSRRVILESRIGKWRVSLCRNHENGLICLNQGWPQFVDRHALKLGEFVVFEHTGDLNFNVSVYKTNFCENEFDDEEEEEGTEALIPLKQSKEEEGTEQSTMKEEEEEEEEEEEEEEEDMFFEKTMKARHATKWATVNIPFAFLRSNNLGMQRRDAVLRDPRSGREWDVKILAERGVWFRMRKGWYAFYESNNLKDGDRCVFRLNRRLLTSTTIVFDVEIIRA...

XP_057791837.1
MEGKHGRSITKDFFKVLMPGFHQKLSLPPIVSKELEKQKSRRVILESRIGKWRVSLCRNHENGLICLNQGWPQFVDRHALKLGEFVVFEHTGDLNFNVSVYKTNFCENEFDDEEEEEGTEALIPLKQSKEEEGTEQSTMKEEEEEEEEEEEDMFFEKTMKARHATKWATVNIPFAFLRSNNLGMQRRDAVLRDPRSGREWDVKILAERGVWFRMRKGWYAFYESNNLKDGDRCVFRLNRRLLTSTTIVFDVEIIRAK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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