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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004816`

染色体: Chr02 坐标: 70305970-70308885 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004816`
名称	SmilChr02G004816
描述	B3 domain-containing protein REM9-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70305970 - 70308885 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008807`
GeneID	`131008807`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008807`
原始查询	`SmilChr02G004816`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B3 domain-containing protein REM9-like
产物	B3 domain-containing protein REM9-like
Arabidopsis	`AT2G24645` (AT2G24645) Transcriptional factor B3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:10723071] identity=26.9; qcov=0.9; evalue=9.83e-20; confidence=low
Rice	`Os03g0621900` - identity=32.6; qcov=0.377; evalue=1.54e-11; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008807

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791842.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791842.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791842.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791842.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791842.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70306242`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	B110,B124,B16,B6,B8,B88,C22,C67
`Chr2:70306303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,B79,B93
`Chr2:70306708`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	29	A2,A22,A25,A3,A8,B107,B112,B113,B115,B121,B123,B18,B22,B32,B36,B39,B52,B67,B85,B91,B99,C1,C10,C13,C21,C29,C40,C41,C71
`Chr2:70306711`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	29	A2,A22,A25,A3,A8,B107,B112,B113,B115,B121,B123,B18,B22,B32,B36,B39,B52,B67,B85,B91,B99,C1,C10,C13,C21,C29,C40,C41,C71
`Chr2:70306736`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	27	A1,A14,A16,A23,B1,B10,B100,B113,B136,B139,B34,B45,B49,B50,B54,B58,B59,B62,B82,C11,C23,C28,C46,C52,C69,C80,D3
`Chr2:70306917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr2:70306997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B140,B55,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791842.1

260 aa

130

260

PF02362 B3 13-102 aa PF02362 B3 156-243 aa

XP_057791843.1

260 aa

130

260

PF02362 B3 13-102 aa PF02362 B3 156-243 aa

XP_057791844.1

260 aa

130

260

PF02362 B3 13-102 aa PF02362 B3 156-243 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791842.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	13	102	1.3e-26	93.2	B3 DNA binding domain
`XP_057791842.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	156	243	1.3e-26	93.2	B3 DNA binding domain
`XP_057791843.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	13	102	1.3e-26	93.2	B3 DNA binding domain
`XP_057791843.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	156	243	1.3e-26	93.2	B3 DNA binding domain
`XP_057791844.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	13	102	1.3e-26	93.2	B3 DNA binding domain
`XP_057791844.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	156	243	1.3e-26	93.2	B3 DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935859.1
GTTTCTTCTCAATAGCCCCCATTCTTTTCGAGTTTCGATCCCTCCCTTATCTCTCTGTGAATCTCGCATTTATTCTCTCTCTCTTCGGCGGCAGCAACAGTCACAGGTAGCCACGGCCGCCGCCGTACACACTACACACCATCATCTCTCTAGCCTCTCGCCCTCTGTCTCACTTCTCCTTCACAAATTCTGGCGCGGCACGAATTTGCTGTTACAGTAGCACGGCGCCGCCCTCGGCTCTATTTTCCCCACTGATTTCG...

XM_057935860.1
CGGCCTAGACCTTGCACTGCAAACTTCGCCATCGCCGTCGCCACCAAAACCAATTGTATGCATCCAATAATTTTCACAGCAATAGTTAAGACGAACAGAAGGAAGGAATAGAATAGGAGTAACTTTCCTCTACTTGCAAAGAAGAAGAAGCAAAACAAGGATTTTGAGGCTGGGGCCGGCGGGATTGAGATGGGAAATCGGGGAAGGGGATGTGAATGTAGACGAAGGGAATTTCTGGGGGTTGGCGGGGAAGGGGAAGT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131008807
ATGGAAGGAAGACATGAGCTCTCAATTACAACGCACTTTGTGAAAGTCATGATGCCTGGTTTCCACGAAAAAATGAACCTTCCACCAATTGTTTCCAAGCAGGTAGAAGCGCGGAAATGGAGAAGAGTGATTCTGGAAAGCCGAATCGGAAAATTTAGCGTGAGTTTGTGCAAAAACCAGGAAAATGGGCTGATCTGTATGAATCGAGGATGGCCTGAATTCGTGGAGCGCCACGCTTTAACAATCGGAGAGTTCGTCTT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057791842.1
MEGRHELSITTHFVKVMMPGFHEKMNLPPIVSKQVEARKWRRVILESRIGKFSVSLCKNQENGLICMNRGWPEFVERHALTIGEFVFFKPTDDLRFNVSVFGTNMTEKEFHNEKKEEEEEEEEEEEEEEEEEEDEEEETLNPMEEARKNGVSKEYFEKRMKPFHAKKKTKVNIPVPFLRANSLGGPQQWRVILNDPKGRSWAVSLSNENSGGIRFRMKAGWPAFYAANRLKDGDYCVFHLNRRLLTPTTIVLDVQIIIRG

XP_057791843.1
MEGRHELSITTHFVKVMMPGFHEKMNLPPIVSKQVEARKWRRVILESRIGKFSVSLCKNQENGLICMNRGWPEFVERHALTIGEFVFFKPTDDLRFNVSVFGTNMTEKEFHNEKKEEEEEEEEEEEEEEEEEEDEEEETLNPMEEARKNGVSKEYFEKRMKPFHAKKKTKVNIPVPFLRANSLGGPQQWRVILNDPKGRSWAVSLSNENSGGIRFRMKAGWPAFYAANRLKDGDYCVFHLNRRLLTPTTIVLDVQIIIRG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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