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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004820`

染色体: Chr02 坐标: 70318681-70323365 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004820`
名称	SmilChr02G004820
描述	phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 6-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70318681 - 70323365 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008814`
GeneID	`131008814`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008814`
原始查询	`SmilChr02G004820`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 6-like
产物	phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase 6-like
Arabidopsis	`AT3G07960` (PIP5K6) Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819987] identity=63.5; qcov=1.08; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0705300` - identity=52.5; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016308 (1-phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase activity); GO:0046488 (phosphatidylinositol metabolic process)
KEGG	smil00562 (Inositol phosphate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04070 (Phosphatidylinositol signaling system - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01504 (PIP5K); PF02493 (MORN)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008814

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791852.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057791852.1`
3	Cell projection	细胞突起	0.40000	`XP_057791852.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057791852.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791852.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70320479`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	C10
`Chr2:70320479`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C10
`Chr2:70320551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:70320583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B20,B98,C18,C45
`Chr2:70320972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,B87,C79
`Chr2:70320983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B125,C58
`Chr2:70320998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr2:70321781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C55
`Chr2:70322141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr2:70322186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:70322373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,D3
`Chr2:70322496`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791852.1

670 aa

335

670

MORN

PIP5K

PF02493 MORN 33-55 aa PF02493 MORN 56-77 aa PF02493 MORN 79-101 aa PF02493 MORN 102-123 aa PF02493 MORN 125-146 aa PF02493 MORN 148-169 aa PF02493 MORN 171-192 aa PF01504 PIP5K 366-664 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791852.1`	Pfam	`PF02493`	MORN	Repeat	33	55	3.6e-32	109.0	MORN repeat
`XP_057791852.1`	Pfam	`PF02493`	MORN	Repeat	56	77	3.6e-32	109.0	MORN repeat
`XP_057791852.1`	Pfam	`PF02493`	MORN	Repeat	79	101	3.6e-32	109.0	MORN repeat
`XP_057791852.1`	Pfam	`PF02493`	MORN	Repeat	102	123	3.6e-32	109.0	MORN repeat
`XP_057791852.1`	Pfam	`PF02493`	MORN	Repeat	125	146	3.6e-32	109.0	MORN repeat
`XP_057791852.1`	Pfam	`PF02493`	MORN	Repeat	148	169	3.6e-32	109.0	MORN repeat
`XP_057791852.1`	Pfam	`PF02493`	MORN	Repeat	171	192	3.6e-32	109.0	MORN repeat
`XP_057791852.1`	Pfam	`PF01504`	PIP5K	Family	366	664	1.1e-104	350.5	Phosphatidylinositol-4-phosphate 5-Kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935869.1
AACATGTCGGCACGCAGATAAACACCCACATCACATACAATATACCAACCTTCTTCTCTTCTTCTCTTCTTCCAATCAATAATCAATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGGAGTTTCAGGCTAAGATGATCGGTTTGTGGCAGCCAAGGCAGTGAATGAGAAATATGGATATTGGTTAAGAAAAGCACAAGTGAAGAAAAAGGCCAAGAAAAAAAAATACTCACAACAATGTCTGTGGCACATGTGGATGATGATGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008814
ATGTCTGTGGCACATGTGGATGATGATGAAGAAGATGACATCCACAAACCTAGCAAACTCCACCATGTTGAGAAGGCTTTCACCAATGGTGACATCTACCTAGGCCAGTGGGCGGAAAACTGCCCGAACGGGCAGGGAAAGTTCCTATGGGCAGATGGCTGCATGTATGTGGGCAGCTGGTGCAGAGGCAAGACCATGGGAAGGGGCAAGTTCAGCTGGCCCTCGGGTGCCACCTACGAGGGCCAGTTCAAGAACGGGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791852.1
MSVAHVDDDEEDDIHKPSKLHHVEKAFTNGDIYLGQWAENCPNGQGKFLWADGCMYVGSWCRGKTMGRGKFSWPSGATYEGQFKNGYMDGEGTYTGSSNDTYRGMWLSNTRHGGGMQSFSNGDCYKGQWCHGQPEGKGRYTWRNGNEYVGGWKEGKMNGVGTLVWANGSLYEGSWQDGLPKGNGTFRWVDGSFYVGVWSEDAREQSGTYYTSSANRGTLDWDPLNVYLVYLRDCSVGAVEKIPVFPSEKTVSWQCGGMPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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