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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004850`

染色体: Chr02 坐标: 70649636-70654261 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004850`
名称	SmilChr02G004850
描述	PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70649636 - 70654261 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008847`
GeneID	`131008847`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008847`
原始查询	`SmilChr02G004850`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like
产物	PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 3-like
Arabidopsis	`AT1G18650` (PDCB3) plasmodesmata callose-binding protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838446] identity=54.7; qcov=1; evalue=1.29e-57; confidence=high
Rice	`Os03g0756300` (OSJNBb0081K01.7) - identity=44.7; qcov=0.989; evalue=1.17e-43; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008847

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057791911.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057791911.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791911.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791911.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791911.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70650890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:70653763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B31,C15,C25,D6
`Chr2:70653785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr2:70653788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B76,C61,C72,D2
`Chr2:70653797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:70653821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,C15,C33,C37
`Chr2:70653827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr2:70653854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr2:70653915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr2:70653931`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C82
`Chr2:70653931`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791911.1

190 aa

190

PF07983 X8 20-91 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791911.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	20	91	6.1e-23	82.0	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935928.1
GCAGGTTTGAATTTGAATGCGCCTCCATATGTGATAAAAAAGTTAAAAAAACCACTATAGTCTATACAATCTCCCATATTTATATTTGGAAAAAAACTCTCGAAGAATCCAAATGACAGTAATTCGTGAAAAGGGACACAATAAAAACAGAGATCAAGGTTAAAAAGACACACACAGTGCCCAAGGCGCAGAAAGAAATTTAACTCGGAGAAGGCGACACCAGTACCCACTAGCTAGCACCAGCCTGGGCCACCTTCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008847
ATGGCTTCTTTGGTTCTTATGGCTCTCCTTTTGGCCATGGCTGGTCACTCCAGTGCGACATGGTGCGTGTGCAAGGACGGGTTAAGTGATCAAGTGCTGCAGAAGGCTCTCGACTACGCATGCGGAGCCGGGGCGGACTGCAACCCGATCCATCAAAGCGGACCCTGTTTCCAACCCAACACCGTTAGGGCTCACTGCAGCTACGCCGCCAACAGCTATTTCCAGAAGAATCGCCAACAAGCCACCGCTTGCGATTTTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791911.1
MASLVLMALLLAMAGHSSATWCVCKDGLSDQVLQKALDYACGAGADCNPIHQSGPCFQPNTVRAHCSYAANSYFQKNRQQATACDFNGAATISASDPSISGCAYPATASASSTPTTTTPGTTTPVSGTTGTSTGNSPVMTNPNTGVLGGPNNGLGPSGMNTDMSDAGIRLPNAVFLCFSVVLAFSALVFW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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