当前解析结果
SmilChr02G004851| 统一新 Gene ID | SmilChr02G004851 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G004851 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G004851 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 70673652 - 70678006 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131008848 |
|---|---|
| GeneID | 131008848 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131008848 |
| 原始查询 | SmilChr02G004851 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os04g0609900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os04g0609900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os04g0609900- identity=28; qcov=0.351; evalue=2.53e-07; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131008848 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057791912.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057791912.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057791912.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057791912.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057791912.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:70675441 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A21,B126,C8,D5 |
Chr2:70675979 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C34 |
Chr2:70676159 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B91 |
Chr2:70676188 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B12 |
Chr2:70676278 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 14 | A11,B105,B17,B35,B72,C14,C19,C47,C48,C49,C52,C71,C75,D4 |
Chr2:70676547 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr2:70676554 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A24,C12,C30 |
Chr2:70676563 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A21,B126,C8,D5 |
Chr2:70676566 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B118 |
Chr2:70676761 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A21,B126,C8,D5 |
Chr2:70676976 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B80 |
Chr2:70676982 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A21,B126,C8,D5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
8 records
下载 cDNA FASTA8 records
下载 CDS FASTA8 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。