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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004859`

染色体: Chr02 坐标: 70720193-70723253 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004859`
名称	SmilChr02G004859
描述	uncharacterized SmilChr02G004859
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70720193 - 70723253 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008857`
GeneID	`131008857`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008857`
原始查询	`SmilChr02G004859`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826583]; symbol=MEE50; hit=AT4G00231; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826583]; symbol=MEE50; hit=AT4G00231; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G00231` (MEE50) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826583] identity=48.3; qcov=1; evalue=1.24e-140; confidence=high
Rice	`Os03g0118900` - identity=44.7; qcov=0.849; evalue=2.68e-109; confidence=medium
GO	GO:0005829 (cytosol)
KEGG	-
Pfam	PF09759 (Atx10homo_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008857

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791934.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057791934.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791934.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791934.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791934.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70721088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,D8
`Chr2:70721197`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,D11
`Chr2:70721205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C32,C68
`Chr2:70721337`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B35,D11
`Chr2:70721337`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B35,D11
`Chr2:70721404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C12
`Chr2:70721419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B137,C31,C47,C7
`Chr2:70721503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,D11
`Chr2:70721523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B30,B53,B65,B88,C51
`Chr2:70721622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:70721642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr2:70721885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B73,C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791934.1

485 aa

242

485

Atx10homo_assoc

PF09759 Atx10homo_assoc 384-477 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791934.1`	Pfam	`PF09759`	Atx10homo_assoc	Repeat	384	477	1.3e-34	118.8	Spinocerebellar ataxia type 10 protein domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096357.1
ATTCTAATTTTGAATAATTGAATTACCCAACCAGTCCAGACCTCCGCCGTCGTCGACCCCGCGCGACTCCACTCTCATCCAGACCCCTGGTCCCGCCGTCCCGCAGCCTGTCTCGTTCAGAATCAGCTCGGATCCGCTCCCCTCCGAGCCTCCGACCCCGTAACAGAGCCACCTCATCTCCAGTCGCGCCACCTCCGATCTCCGGCACTCCACGACTCAGGCAGTCTTGACTCTTAAGGATTTGAATTCTGGAATATTAT...

XR_009096356.1
ATTCTAATTTTGAATAATTGAATTACCCAACCAGTCCAGACCTCCGCCGTCGTCGACCCCGCGCGACTCCACTCTCATCCAGACCCCTGGTCCCGCCGTCCCGCAGCCTGTCTCGTTCAGAATCAGCTCGGATCCGCTCCCCTCCGAGCCTCCGACCCCGTAACAGAGCCACCTCATCTCCAGTCGCGCCACCTCCGATCTCCGGCACTCCACGACTCAGGCAGTCTTGACTCTTAAGGATTTGAATTCTGGAATATTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008857
ATGGATGAAATGGAAAATGTATATGAGCATCTCTTAGTTGCTTCTGACTCTTCGACATTAAAAGAATCACTCGAGTGTCTCATTGAAACTGCAAAAACTTCTGATGGCCGGTTAGACCTTGCTTGCAAGCGTATTGTTGTACTAGTCCTCAGGCTCTGCCAATCTCCACTTCAACTTTCTGTTGAAGACCTTTTCTTATCGATAAAGCTACTTAGGAACTTGTGTGCTGGTGAAATTAATAACCAGGATCTATTTATTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791934.1
MDEMENVYEHLLVASDSSTLKESLECLIETAKTSDGRLDLACKRIVVLVLRLCQSPLQLSVEDLFLSIKLLRNLCAGEINNQDLFIQLNGVVIISTLINSMGFVCGSDNRTLHMILQLLGNVSLAGEQHRNVVWRQFFPLVFLDIARVQNKETCDTLSMVIYTCVKGSSERAVKFLGDAGLDIIVEIIRTVTIVGYREHWVKLLLFKICFEDSYFSPIFSKLSPVAEAENSDTNVGKNNSFGAEQALLLSILSEILNEEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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