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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004861`

染色体: Chr02 坐标: 70745304-70746864 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004861`
名称	SmilChr02G004861
描述	uncharacterized SmilChr02G004861
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70745304 - 70746864 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008859`
GeneID	`131008859`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008859`
原始查询	`SmilChr02G004861`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836255]; symbol=AT5G61340; hit=AT5G61340; species=arabidopsis; confidence=high
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836255]; symbol=AT5G61340; hit=AT5G61340; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G61340` (AT5G61340) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836255] identity=45.7; qcov=1.01; evalue=5.72e-61; confidence=high
Rice	`Os12g0577200` - identity=35; qcov=1.1; evalue=4.53e-41; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29520 (DUF8558)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008859

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057791937.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057791937.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057791937.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057791937.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791937.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70745856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C72
`Chr2:70745900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr2:70745909`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C44
`Chr2:70746047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C85
`Chr2:70746336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C44
`Chr2:70746389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr2:70746431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791937.1

310 aa

155

310

DUF8558

PF29520 DUF8558 119-275 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791937.1`	Pfam	`PF29520`	DUF8558	Domain	119	275	6.6e-11	42.8	Domain of unknown function (DUF8558)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935954.1
AGATGCAAACATGATATTGGCGCGATCCCTTGGAGCGGGGGACCGGAGATCACAAGGACACATATAAAAACAGCACAAACTAAGAAGAATTGATGAAAACGAAGGTGAGACAACTCCATCTATGCTGTCTTTTTCTTCTTGGTATCTCCTCTCTCTCTCTCTCTTGTAGTCTTTTAGCTGTTGGCCAATCCAATTTCACCCATAAACACCAAACATCAACAATCAAATTCAATTAAGCCAACACAAATCACAATCTCTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008859
ATGGCAAAAACAAGCACAAACATCATGAGAAGATCAATCTTCACCTTCCTCAAAAACTACCAACACTTGACCTCCACCCCCATCCTCCTCCTCCTCCCCTTCGCCGTCTGCGGCCTCCTCGCCCCGCCCCTCGTCTCCTCCTCGCGCCTCCTCCCGCTAGTCCACGGCCGCCTCACCTCCCTCTTCCTCGCCGCAGGCTTCCCTCCATCCTCACCCCTCCTCAACATCCTCAACCTCAAGCTCTCCCAAACCACCCTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791937.1
MAKTSTNIMRRSIFTFLKNYQHLTSTPILLLLPFAVCGLLAPPLVSSSRLLPLVHGRLTSLFLAAGFPPSSPLLNILNLKLSQTTLASLLVSPLSCSSLLLAKAAVVGTLHHNTSNPSQLYKPLLITQLCNSLLILAANATCFFLLAIFFICLDILGLSSPSSLLFSAVGAILCSIILAHAYIICNLALASSAMEKRGGLMPIIEACLVIKGRSATALSLALPINLALAAIEALFEYRVVGAYNNQALNRPAIILLEGML...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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