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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004862`

染色体: Chr02 坐标: 70749785-70750971 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004862`
名称	SmilChr02G004862
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 8-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70749785 - 70750971 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008864`
GeneID	`131008864`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008864`
原始查询	`SmilChr02G004862`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 8-like
产物	transcription initiation factor TFIID subunit 8-like
Arabidopsis	`AT1G31240` (AT1G31240) Bromodomain transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840012] identity=33.2; qcov=0.992; evalue=3.23e-28; confidence=low
Rice	`Os02g0699900` - identity=33.5; qcov=0.829; evalue=1.74e-22; confidence=low
GO	GO:0005669 (transcription factor TFIID complex); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	smil03022 (Basal transcription factors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF07524 (Bromo_TP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008864

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791943.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791943.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791943.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791943.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791943.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70749974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:70749991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	59	A15,A18,A21,A23,A5,A9,B100,B102,B105,B106,B12,B120,B123,B124,B125,B126,B128,B134,B136,B15,B21,B28,B44,B50,B55,B6,B69,B70,B77,B87,B94,B97,C11,C13,C21,C23,C29,C30,C33,C34,C38,C41,C46,C48,C49,C58,C60,C67,C69,C71,C75,C78,C82,C87,C9,D1,D11,D4,D9
`Chr2:70750022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C31,C47,C7,C77
`Chr2:70750031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:70750147`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B101
`Chr2:70750147`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B101
`Chr2:70750150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:70750188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B81
`Chr2:70750188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr2:70750287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C29
`Chr2:70750299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B42,C73,C86
`Chr2:70750325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C73,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791943.1

252 aa

126

252

Bromo_TP

PF07524 Bromo_TP 14-84 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791943.1`	Pfam	`PF07524`	Bromo_TP	Domain	14	84	7e-20	71.5	Bromodomain associated

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935960.1
AAATAAATAATAAAAGTCGCGAAACCTGCCCCCAGAACCCTCGGCCTCACCACATTCCACCCCACCGCCGCCACCGCCGCCCCAAAAGCCTTTCCGCATCTCTCTAACATCACTGCACTTCCACCAGCGTTCGCCGCCACCAAACATCGCCTCTTATTGTTTTCTCCGACAACCACCAGGCCTTCAACCACAGGTTCCCGTCGTGGGGAGTGGATGCAAAATATTTAGTTTCCCCCAATTCGCGAATATCAATGCGGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008864
ATGCGGGAAGAGAAAATCATCGGCGACGCGGCGGTGCCGGAATTCTCATTTAGCCTAGCTCGAGTGGCGGTAGCGCAGATCTGTCAATCGATAGGCTACAAAGGAGCTGAGAGGCCGGCGCTCGAATCCCTAACCGACATCGCCACCAGATATTTGAAAGCGGTAGCCAAATTGAGCGCGGAATCCGCCAATTCGAGCGGGCGCACCGAATCAAACCTCTTCGACATCGTCGCCGCGATCGAAGACTTGACATCGGTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791943.1
MREEKIIGDAAVPEFSFSLARVAVAQICQSIGYKGAERPALESLTDIATRYLKAVAKLSAESANSSGRTESNLFDIVAAIEDLTSVQGFDGAWRVRSRSLWRSAVIRDLMKLVKYTDQTPFAQPLPPRRSCSDKERLSKYRDESGWYNEGRLKHVPLWLPAVVERGGGAEEREGEVKWEESLEREKAANLGCNEMKKLKRECNGEGVEQVRVKRGKVRFKIGDFGNLRVNCENNGGGSGGGGGRGEGDYDGY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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