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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004863`

染色体: Chr02 坐标: 70757321-70760043 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004863`
名称	SmilChr02G004863
描述	probable receptor-like protein kinase At5g61350
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70757321 - 70760043 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008860`
GeneID	`131008860`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008860`
原始查询	`SmilChr02G004863`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable receptor-like protein kinase At5g61350
产物	probable receptor-like protein kinase At5g61350
Arabidopsis	`AT5G61350` (AT5G61350) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836256] identity=62.8; qcov=0.983; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0759600` (OsCrRLK1L1) - identity=58.7; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004714 (transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0046777 (protein autophosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF11721 (Malectin); PF12819 (Malectin_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008860

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057791938.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791938.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791938.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791938.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791938.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70757499`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	B114,B117,B2,B55,B6,B63,B76,B95,C1,C27,C37,C63,D2,D5
`Chr2:70757500`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A2,A7,B122,B125,B138,B26,B35,B40,B47,B53,B59,B71,B80,B95,C19,C22,C4,C45,C62,C76,D8
`Chr2:70757560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,B94
`Chr2:70757602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,C29,C33
`Chr2:70757616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B60,B79,C68,C80
`Chr2:70757664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B97,C42
`Chr2:70757686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C33
`Chr2:70757848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr2:70757891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B54,C16,C21,C73
`Chr2:70757977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:70758019`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr2:70758052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791938.1

807 aa

404

807

Malectin_like

Malectin

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF12819 Malectin_like 32-383 aa PF11721 Malectin 295-360 aa PF00069 Pkinase 495-699 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 497-696 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791938.1`	Pfam	`PF12819`	Malectin_like	Domain	32	383	5.1e-25	89.2	Malectin-like domain
`XP_057791938.1`	Pfam	`PF11721`	Malectin	Domain	295	360	1.9e-10	41.8	Malectin domain
`XP_057791938.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	495	699	9.8e-40	137.3	Protein kinase domain
`XP_057791938.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	497	696	2e-44	152.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935955.1
TTTCATTACAAGATCGCACGTTCTCCCCCAACCCCAACATGCTTCCAACAATCATTCCCACCCTAAAAAACACTAGTGTTTTTAGTTTGTCAAAACACAAACTCTTCTCATACTTCCCATCTCCGCCGCCCTAACACCGCCGCGGAAATGGGTCCCATTTCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCATCAATGCCGACGCCAAATCTTCTTCTTCCTCATTCACTCCCGCAGATAACTACCTCATCAACTGCGGATCACCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008860
ATGGGTCCCATTTCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCATCAATGCCGACGCCAAATCTTCTTCTTCCTCATTCACTCCCGCAGATAACTACCTCATCAACTGCGGATCACCTGATCCCACCCTTCTCGACGACGCCAGGACTTTCAAATCCGACCCCCAATCCTCTTCCTACTTATCCACAGACGAAGACATTCTAGCTTCCGTCGCTTCTCTTCCCGACGCTCCGCCGCCGTCGCTGTTTCTGACTGCAAGAATCTTCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791938.1
MGPISLLLLLLFINADAKSSSSSFTPADNYLINCGSPDPTLLDDARTFKSDPQSSSYLSTDEDILASVASLPDAPPPSLFLTARIFHHTSMYRFLITKPGLHWIRLHFHPLPHPTYNLTSATFSVSTDDTVLLHGFSAATAVFKEYLINTTSDKLTLKFSPMRNSVAFVNALEVVSAPDDLVPDSASAVPAGEASVVNKYAFEVSYRLNVGGPAVTPRNDTLSRTWRTSGEFMAFPDGARNVSVPNDAITYPSGGATPLT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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