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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004864`

染色体: Chr02 坐标: 70761104-70763084 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004864`
名称	SmilChr02G004864
描述	probable xyloglucan 6-xylosyltransferase 3
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70761104 - 70763084 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008862`
GeneID	`131008862`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008862`
原始查询	`SmilChr02G004864`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable xyloglucan 6-xylosyltransferase 3
产物	probable xyloglucan 6-xylosyltransferase 3
Arabidopsis	`AT5G07720` (XXT3) Galactosyl transferase GMA12/MNN10 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830665] identity=67.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0529600` (OsGT2) - identity=58.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005768 (endosome); GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0009969 (xyloglucan biosynthetic process); GO:0016020 (membrane); GO:0016758 (hexosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF05637 (Glyco_transf_34)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008862

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057791942.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057791942.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791942.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791942.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791942.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70761417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C18
`Chr2:70761435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr2:70761492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr2:70761525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B98
`Chr2:70761661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B134,C46,C79
`Chr2:70761708`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B21,B37
`Chr2:70761711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr2:70761714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,D6
`Chr2:70761732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:70761771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr2:70761780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,B9,C57
`Chr2:70761822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C31,C47,C7,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791942.1

452 aa

226

452

Glyco_transf_34

PF05637 Glyco_transf_34 153-390 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791942.1`	Pfam	`PF05637`	Glyco_transf_34	Family	153	390	8.6e-59	199.9	galactosyl transferase GMA12/MNN10 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935959.1
TAATTAAATAAACCGTTGATATTACACTGAGTTTTGCTAATATATAGCACTGGCGCCAATAAAAATAGAAAATAGGAAGATGACAAAAATAGATTTATAGAATTTAACATTTTCTTTTAATCGAAGAAGATAAGATGCAGAACCCCAACATAAAGATGGCAATCAATGGCAGCTTCAACATAGCCCCAAACAGGGCCCCCGCAGTCGCGCTCAATCCACCCACCACTCCCCTGCATTATTCATCAAAACTATTCAATTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008862
ATGGGAGCGGAGGCGACGTATTCCGCCCAGAAGCGGAGCTCCACAATTCTGCCCCAAACGACGGCCGCCGCCGCCAACGGTGCCGCCCGCGGCCACCTCCCCAAGGGTCGGCAGGCCGACCGCACATTCAACAACATCAAGATAACAATCCTCTGCGGATTCGTCACCATCCTCGTCCTCCGCGGCACAATCGGCCTCAACAACCTCGTCTCCTTCGAGGCCGAAGCAGAGAGCCAATACCTAATCGAGGAAACCAGGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791942.1
MGAEATYSAQKRSSTILPQTTAAAANGAARGHLPKGRQADRTFNNIKITILCGFVTILVLRGTIGLNNLVSFEAEAESQYLIEETRRIVAAIRSDDDPLDSDSDSDSNSDASEKTPNSNSSSILGPKITNWDEDKKLWRRRNPQFPYYINGRPKTYLVTGSPPRPCENAIGDHYLLKFLKNKIDYCRIHGIEIVYNMAHLDKEMAGSWSKLPLMRRLMVAHPEAEWIWWMDSDALFTDMVFEIPFHRYRGSNLVIHGYPD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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