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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004865`

染色体: Chr02 坐标: 70763815-70766556 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004865`
名称	SmilChr02G004865
描述	vesicle transport v-SNARE 13-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70763815 - 70766556 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008865`
GeneID	`131008865`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008865`
原始查询	`SmilChr02G004865`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vesicle transport v-SNARE 13-like
产物	vesicle transport v-SNARE 13-like
Arabidopsis	`AT3G29100` (VTI13) vesicle transport V-snare 13 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822557] identity=75.6; qcov=0.995; evalue=2.06e-125; confidence=high
Rice	`Os01g0707300` (P0692C11.36-1) - identity=74.9; qcov=0.986; evalue=2.72e-113; confidence=high
GO	GO:0000149 (SNARE binding); GO:0005484 (SNAP receptor activity); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006906 (vesicle fusion); GO:0012507 (ER to Golgi transport vesicle membrane); GO:0016192 (vesicle-mediated transport); GO:0031201 (SNARE complex); GO:0031902 (late endosome membrane)
KEGG	smil04130 (SNARE interactions in vesicular transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05008 (V-SNARE); PF12352 (V-SNARE_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008865

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057791944.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057791944.1`
3	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057791944.1`
4	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057791944.1`
5	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057791944.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70766303`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C13
`Chr2:70766303`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C13
`Chr2:70766361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B86,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791944.1

222 aa

111

222

V-SNARE

V-SNARE_C

PF05008 V-SNARE 1-91 aa PF12352 V-SNARE_C 128-193 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791944.1`	Pfam	`PF05008`	V-SNARE	Domain	1	91	3.7e-33	114.6	Vesicle transport v-SNARE protein N-terminus
`XP_057791944.1`	Pfam	`PF12352`	V-SNARE_C	Domain	128	193	3.2e-21	76.1	Snare region anchored in the vesicle membrane C-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935961.1
TCGGAATCATTATGAGCCTCTCTCCATTAACGTTTTAAACAATTTTCCGAAGGCCATCAACGTTAACCGTTCTAGATTGTTCCAACAAAATTTCATCGCATTTCGGAGTGTTTTCTCCGATCATTGCCTTCTCTTTTCCGGCGCCGATCCGATCAACCTAAGGAGATTGTTGAGGGATCAAAAGATGAGTCAAGTATTTGAAGGTTATGAGCGGCAATACTGTGAGATATCTGCTAATCTTTCGAAGAAGATTACTTCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008865
ATGAGTCAAGTATTTGAAGGTTATGAGCGGCAATACTGTGAGATATCTGCTAATCTTTCGAAGAAGATTACTTCAGCTAGTGTCCTTGATGGCGAACAAAAGAAACAGAAACTATCTGAAGTTACTGAAGGATTAGAAGATGCTGAGGCACTGATACGTAAAATGGATCTAGAAGCTCGGAGCTTGCCCCCGAGTGTGAAAGCTACACTTCTTGTCAAGTTGAGAGAGTACAAAACAGATTTGAACAATTTGAAATCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791944.1
MSQVFEGYERQYCEISANLSKKITSASVLDGEQKKQKLSEVTEGLEDAEALIRKMDLEARSLPPSVKATLLVKLREYKTDLNNLKSEVKRIASGNANQAARDDLLESGMANTLTASADQRARLLMSTEKLGKSSDRIREGRKTMLETEELGVSILQDLHQQRQALLHAHNTLHGVDDNIGRSKKILTNMSRRMSRNKWIIGIIIAVLVIAILVILYFKLTRR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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