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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004871`

染色体: Chr02 坐标: 70798604-70803077 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004871`
名称	SmilChr02G004871
描述	hydroxyproline O-galactosyltransferase GALT6-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70798604 - 70803077 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008868`
GeneID	`131008868`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008868`
原始查询	`SmilChr02G004871`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hydroxyproline O-galactosyltransferase GALT6-like
产物	hydroxyproline O-galactosyltransferase GALT6-like
Arabidopsis	`AT5G62620` (AT5G62620) Galactosyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836383] identity=58.2; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0195200` - identity=55.8; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0006486 (GO:0006486); GO:0008378 (galactosyltransferase activity); GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	-
Pfam	PF00337 (Gal-bind_lectin); PF01762 (Galactosyl_T)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008868

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057791948.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057791948.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791948.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791948.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791948.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70798849`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B102
`Chr2:70798849`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B102
`Chr2:70798940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:70798948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr2:70798955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr2:70798984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr2:70799090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:70799167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B66
`Chr2:70799273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,C24,C51
`Chr2:70799362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:70799419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:70799477`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791948.1

639 aa

320

639

Gal-bind_lectin

Galactosyl_T

PF00337 Gal-bind_lectin 173-357 aa PF01762 Galactosyl_T 406-586 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791948.1`	Pfam	`PF00337`	Gal-bind_lectin	Domain	173	357	4.7e-30	104.5	Galactoside-binding lectin
`XP_057791948.1`	Pfam	`PF01762`	Galactosyl_T	Family	406	586	1e-31	111.0	Galactosyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935965.1
CAAACACTCACCTATATATATAACTCCTCACACACTCTCTCTTGATGAAGGAGGATTTACAGCTTATGTATTGTTTTGCACTTCTGTTAACATAAAATCTTTCTGTGCAGACCTTTTTCTCTCCATTTTACTGTTTCAGTTTGTTTAACGATAACTCGCCATTATTAAACTTGGTTAAATAGATAGTTTCAGCCTCTGTTTTTCCCTCCCTTTCTTGACAAAAACACCATCAATTAAAATAAAATGAAAAGGACGAAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008868
ATGAAAAGGACGAAATCAGCCGTGTTGATTCCGCTAAACAGGCAAAGATGGCTCCGCATTCTAAATTTTTTGGTTGTCTCCTGCGCTATTCTGGTCATTTACGAAGCCGCGTACATGTTCAAAAACGGGTTGTATTCGGTTTCGCAAGAAGGCCTTTACAGCAACAGTAATGGGTTTTTTCTCAACTCGAAGTTGGTTATGGAGAATTTGGAGTGGCGGGAGGCCCCCATTCGCCCTCTCGACGTCCCATTTCGATCAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791948.1
MKRTKSAVLIPLNRQRWLRILNFLVVSCAILVIYEAAYMFKNGLYSVSQEGLYSNSNGFFLNSKLVMENLEWREAPIRPLDVPFRSRKHRGIPKKLLSGLNFTAIAAYSRENGILKSANDAVELGRKLWREVEESRRSERGFGFSSNVTDEVEKCPYSMLISGEEFGGNGGVAVLPCGLALGSHITVVGKPREAQFMVELQGLKTVEGEDPPRILHFNPRLKGDWSGRPVIELNTCYRMQWGVSQRCQGWMSGADQETVD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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