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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004872`

染色体: Chr02 坐标: 70805775-70807636 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004872`
名称	SmilChr02G004872
描述	AAA-ATPase ASD, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70805775 - 70807636 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008870`
GeneID	`131008870`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008870`
原始查询	`SmilChr02G004872`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AAA-ATPase ASD, mitochondrial-like
产物	AAA-ATPase ASD%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G40010` (AATP1) AAA-ATPase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833998] identity=56.7; qcov=0.943; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0639200` - identity=51.5; qcov=0.951; evalue=4.09e-164; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF00004 (AAA); PF14363 (AAA_assoc); PF25568 (AAA_lid_At3g28540)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008870

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057791950.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057791950.1`
3	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057791950.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791950.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791950.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70805986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:70806356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B122
`Chr2:70806445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr2:70806616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B17,B66,B68,C18
`Chr2:70806733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B68,C18
`Chr2:70806935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B84,C39,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791950.1

488 aa

244

488

AAA_assoc

AAA

AAA_lid_At3g28540

PF14363 AAA_assoc 33-126 aa PF00004 AAA 244-391 aa PF25568 AAA_lid_At3g28540 393-462 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791950.1`	Pfam	`PF14363`	AAA_assoc	Family	33	126	6.1e-23	81.8	Domain associated at C-terminal with AAA
`XP_057791950.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	244	391	3.2e-20	73.6	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
`XP_057791950.1`	Pfam	`PF25568`	AAA_lid_At3g28540	Domain	393	462	4.5e-32	110.5	At3g28540-like, AAA+ ATPase lid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935967.1
ATCTCAAATAAAACCAAATTTATATACGTATACTTTCCACTACCACGCTGACTCATACTATCAATATATGCCCTTTCCTTACCTACTTTTCATGCTATAAAAACACACTCTCATCTTGCATTTCTAAATCAATCAAATTATCAAACTGAGAAAAATAAACTGAGAAAACAAACTTACCCAACAAAATGATCATTCCAGTTAGCAGCATGCCGGAGACTTGGGGCGCCGTCGGGTCGGCCGTCGTCACCTTCATCTTCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008870
ATGATCATTCCAGTTAGCAGCATGCCGGAGACTTGGGGCGCCGTCGGGTCGGCCGTCGTCACCTTCATCTTCTTCTGGGACATGTTCCGGCGGTATTGCCCGCCGGAGCTCCGGCGTTACCTCGAGAAATGCACCTCGAGGCTGTCCGGATTCTTGAACCCATACATCCAGATTTCCATCCATGAGTACACCGGAAATCATCTGAGGCCGCACGAGGCCTACAGCATCGTAGACGCGTACCTGAGCGTGAATTCCACCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791950.1
MIIPVSSMPETWGAVGSAVVTFIFFWDMFRRYCPPELRRYLEKCTSRLSGFLNPYIQISIHEYTGNHLRPHEAYSIVDAYLSVNSTDAKRLKAEMTKENENKLMLSMDEYEKTTDEFNGVQVKWISGKVSPPPRAGGVSYYPEPDRRYYKLKFHKCYKKMMTEAYLEHVIKRGREIQARNRQRKLYTNGHSKSYWSHIVFEHPAKFSTLAMEQEKKEEIVEDLLTFTKSKDYYARIGKAWKRGYLLYGPPGTGKSTMIAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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