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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004876`

染色体: Chr02 坐标: 70840325-70842185 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004876`
名称	SmilChr02G004876
描述	LOB domain-containing protein 27-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70840325 - 70842185 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008873`
GeneID	`131008873`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008873`
原始查询	`SmilChr02G004876`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LOB domain-containing protein 27-like
产物	LOB domain-containing protein 27-like
Arabidopsis	`AT3G47870` (LBD27) LOB domain-containing protein 27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823943] identity=58.6; qcov=0.393; evalue=6.98e-41; confidence=low
Rice	`Os08g0402100` - identity=50.5; qcov=0.376; evalue=2.74e-29; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03195 (LOB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008873

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791953.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791953.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791953.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791953.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791953.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70840709`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr2:70840712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,B71,C62
`Chr2:70841093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr2:70841148`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr2:70841238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B20,B69,C36,D5
`Chr2:70841351`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	133	A1,A10,A15,A16,A19,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A4,A7,A8,A9,B10,B103,B104,B105,B108,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B122,B124,B127,B132,B135,B137,B138,B139,B14,B15,B17,B18,B25,B26,B29,B31,B34,B36,B38,B39,B44,B45,B47,B48,B52,B53,B56,B57,B58,B59,B61,B62,B64,B67,B69,B71,B74,B76,B77,B78,B8,B80,B81,B83,B85,B87,B88,B95,B96,C1,C10,C11,C13,C14,C15,C16,C18,C19,C20,C22,C23,C24,C27,C28,C3,C31,C33,C34,C35,C37,C39,C42,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C50,C52,C55,C56,C58,C59,C6,C60,C62,C65,C67,C69,C7,C71,C75,C79,C8,C81,C83,C84,C87,D11,D2,D3,D4,D7,D9
`Chr2:70841353`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	47	A19,A20,A21,A24,A4,B10,B104,B113,B114,B117,B132,B14,B15,B25,B39,B48,B56,B57,B64,B76,B77,B78,B8,B87,B96,C1,C11,C13,C14,C16,C20,C22,C23,C27,C28,C31,C34,C35,C47,C48,C5,C62,C7,C8,C83,D2,D9
`Chr2:70841366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr2:70841523`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr2:70841664`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791953.1

295 aa

148

295

LOB

PF03195 LOB 10-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791953.1`	Pfam	`PF03195`	LOB	Family	10	108	1.4e-32	112.9	Lateral organ boundaries (LOB) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935970.1
GCACGTGTAAATTGAAGAAGATGTAGAAAGTGAAAAAAGCTTACTATATTAAAGCAGAAAAAAGGAAGTGTTAGCACATCGTACATGTGTAAGGTCCGCATGAAAATAGGGTTGAGGTTGCTGAAACAACACCACTTGTCCCCAACTAACTGTCAATACATCTCAAAGAAACTTCCCCACATATTCGGCTCCACCATTTTTACTCAGTCTCCCTCCCCACTCCCCTCCACCTAAGTCTAAGTGCATTCATTCCCAAATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008873
ATGACCATTAAGAGTGGCACTGGCCAGGCCTGCGCTGCTTGCAAGTACCAACGCCGTCGCTGCACACCGGAATGCCTCCTCGCCCCCTTCTTCCCGGCCGACCAGCCCAAGATGTTCCAGAACGTCCACCGCCTCTTCGGCGTCAAGAACATCCAGAACCTCCTCAAGGAGCTCGGCCCCGACCACCACCAGAAGGCCACCGCCATGAAGTCCATCAAGTTCCACGCCACCATGCGCGACAAGTACCCTGTCTGGGGCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791953.1
MTIKSGTGQACAACKYQRRRCTPECLLAPFFPADQPKMFQNVHRLFGVKNIQNLLKELGPDHHQKATAMKSIKFHATMRDKYPVWGCMVEIQHLTYQIQLAEDELQAVLHQIAFYRQQQHQHQPQQDHPLSPTAADDYISELQLGMAPPGNDAAAFAPQQQQVVSYSNSSNGGGGDYGINYLDFKEMNSVVNSMCQQAYSNISNDNNPNSVVTQSHHLMMHAQPLHQPPPQDYAEMQPFFDNIDDTQSYIGSKEAYDQSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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