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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004879`

染色体: Chr02 坐标: 70876207-70877459 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004879`
名称	SmilChr02G004879
描述	deaminated glutathione amidase, chloroplastic/cytosolic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70876207 - 70877459 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008877`
GeneID	`131008877`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008877`
原始查询	`SmilChr02G004879`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	deaminated glutathione amidase, chloroplastic/cytosolic
产物	deaminated glutathione amidase%2C chloroplastic/cytosolic
Arabidopsis	`AT4G08790` (AT4G08790) Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826449] identity=76.2; qcov=0.962; evalue=2.53e-159; confidence=high
Rice	`Os12g0502500` (OsCPA4) - identity=71; qcov=0.958; evalue=7.1e-153; confidence=high
GO	GO:0006807 (GO:0006807); GO:0016811 (hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in linear amides)
KEGG	-
Pfam	PF00795 (CN_hydrolase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008877

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057791959.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057791959.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057791959.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791959.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791959.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70876406`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D4
`Chr2:70876406`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D4
`Chr2:70876408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr2:70876581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B63,B83,C26,C63
`Chr2:70876633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr2:70876677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr2:70876706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B11
`Chr2:70876713`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B21,C57
`Chr2:70876762`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A15,A4,B124,B125,B137,B8,B93,C17,C21,C43,C51,C65
`Chr2:70876783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr2:70876791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B108,B97
`Chr2:70876846`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	35	A15,A23,A25,A4,B1,B102,B111,B112,B124,B125,B134,B137,B18,B21,B3,B31,B41,B49,B59,B66,B8,B83,B86,B93,C15,C17,C21,C22,C29,C43,C51,C63,C67,C74,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791959.1

288 aa

144

288

CN_hydrolase

PF00795 CN_hydrolase 11-268 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791959.1`	Pfam	`PF00795`	CN_hydrolase	Family	11	268	4.2e-62	210.5	Carbon-nitrogen hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935976.1
AAGCCCAACCCAATATAAATTGACAAATTTCGTTTAGGCCCATTATCGTCGTACCCTACCCGAGATATGATCCATGACCCGCTACATTGTAAGGATATTTGAAGCCGTTTGATATAAGCCAAACATAGAAGATCCAACGGCCGTTAAAATCAAACATTTTACGAAGTAAGCTCACAAGCACAAGTCGCAACACACTCTTCTCTTCATCTCCGTCGCTTGATGGAAGCAGCAGCCATGGTCAACACCGTGCGGGTCGCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008877
ATGGAAGCAGCAGCCATGGTCAACACCGTGCGGGTCGCCACGGCGCAGATGACCTCCGTCAACGACCTCTCCGCCAACTTCGCCACCTGCTCTCGCCTTGTGAAGGAAGCAGTCACCGCCGGCGCCAAGTTGCTCTGTTTCCCGGAGAATTTCTCCTACGTCGGCTCGAAATCCGGCGACAGCCTCACGATCTGCGAGCCACTAGACGGTCCGATCATGGAGAAGTACCGCTCACTAGCTAGGGATTCAAGTATCTGGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791959.1
MEAAAMVNTVRVATAQMTSVNDLSANFATCSRLVKEAVTAGAKLLCFPENFSYVGSKSGDSLTICEPLDGPIMEKYRSLARDSSIWLSLGGFQEKGSDDSHLRNTHVIIDDAGNIRSKYSKMHLFDVDVPGGAVYKEGSFTEAGEEIVAVDSPFGKLGLTVCYDLRFPEIYQQLRFHRGAEVLLVPAAFTKPTGHAHWEILLRARAIETQCYVIAAAQAGIHSDERESYGDSMIIDPWGTVVGRLPDRLSTGIAVADIDF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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