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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004885`

染色体: Chr02 坐标: 70929384-70932180 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004885`
名称	SmilChr02G004885
描述	homeobox-leucine zipper protein HAT5-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70929384 - 70932180 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008882`
GeneID	`131008882`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008882`
原始查询	`SmilChr02G004885`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homeobox-leucine zipper protein HAT5-like
产物	homeobox-leucine zipper protein HAT5-like
Arabidopsis	`AT3G01470` (HB-1) homeobox 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821138] identity=54.3; qcov=0.467; evalue=1.34e-39; confidence=medium
Rice	`Os08g0416000` (Oshox5) - identity=65.9; qcov=0.303; evalue=1.4e-37; confidence=low
GO	GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00046 (Homeodomain); PF02183 (HALZ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008882

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057791967.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791967.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057791967.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057791967.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057791967.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70929766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:70929782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr2:70929808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B29,C82,D10,D7
`Chr2:70929854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,B78,C56
`Chr2:70929927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C72,D9
`Chr2:70929949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr2:70929993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,C82
`Chr2:70930033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B108,B132,C23,C85
`Chr2:70930186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B130,B132,B89,C33
`Chr2:70930369`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,B78,C56
`Chr2:70930450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr2:70930516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791967.1

300 aa

150

300

Homeodomain

HALZ

PF00046 Homeodomain 79-132 aa PF02183 HALZ 134-173 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791967.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	79	132	1.6e-17	63.8	Homeodomain
`XP_057791967.1`	Pfam	`PF02183`	HALZ	Coiled-coil	134	173	1.9e-13	51.0	Homeobox associated leucine zipper

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935984.1
TTTTTTTTTCCTTTTAAATTAGAAGAGGTATTATTATATAATCAAATAATACACCACACGGTGGAAAATATCAAATACACGCAGGCTGAGAATCTCTACATCACACAAAAATAAAAAATAAAATAATTGATAACCACACACTATCGGAACCACTACCTATACAAAAATGAGAAAACTCTACATGTGCAATCTCATAAAGGAGAAATCTTAGTTTGTTGACCTAGCTCAACTCAAGCTTAGTGAAATCCGTGTGACCTAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008882
ATGGCAGGTTCCGCGGCGGTCTACGGCGGTGGTGATGCCCCAAATCAAGCGAAGAAACGCAAGTTCAATCAGCCTCTTGATTCGATTGCTGCAGAATCTTCGCTAGGCTCGAATACAATGCTCAACTTTGGAGCTGTTGGTGGTGTGAAAAGATCAAGAAACATGTTATTTTCATCTTTAGATCAAGAAGAGTTTGGAGAAGAATACTTGGATGAGTATTTTAATCAACAAGAAAAGAAGAGGCGCCTTACTGCCGACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791967.1
MAGSAAVYGGGDAPNQAKKRKFNQPLDSIAAESSLGSNTMLNFGAVGGVKRSRNMLFSSLDQEEFGEEYLDEYFNQQEKKRRLTADQVQFLERSFEADNKLEPERKVQLANELGLKPRQIAVWFQNRRARWKTKQLETDYETFHARYETLKSDYDNLVKENDKLKAEVLRLKQNDVGGDAEKVNLHLLDNKGLPKAMPREANARVISEDEESNGSVFAFKNEEQSSAKSEASNVGSPRLTDGIHSPLLESGITSHAFDRD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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