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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004889`

染色体: Chr02 坐标: 70945121-70947069 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004889`
名称	SmilChr02G004889
描述	uncharacterized SmilChr02G004889
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70945121 - 70947069 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008886`
GeneID	`131008886`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008886`
原始查询	`SmilChr02G004889`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane protein, putative (DUF1118) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843812]; symbol=AT1G74730; hit=AT1G74730; species=arabidopsis; confidence=high
产物	transmembrane protein, putative (DUF1118) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843812]; symbol=AT1G74730; hit=AT1G74730; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G74730` (AT1G74730) transmembrane protein, putative (DUF1118) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843812] identity=62.5; qcov=1; evalue=8.57e-61; confidence=high
Rice	`Os01g0585300` - identity=70.1; qcov=0.818; evalue=3.86e-48; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06549 (DUF1118)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008886

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057791970.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057791970.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057791970.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791970.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057791970.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70945333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B16,C28
`Chr2:70945388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C12
`Chr2:70945478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:70946824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B108,C23,C85
`Chr2:70946834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B41,B99,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791970.1

192 aa

192

DUF1118

PF06549 DUF1118 77-190 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791970.1`	Pfam	`PF06549`	DUF1118	Family	77	190	9e-47	158.9	Protein of unknown function (DUF1118)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935987.1
GTTATGGGGTCCGTACGTGCACCCGGTAACCACCTCAGATCCAGATAGGATAAGCAGCGCCCTGATTGGCGGAGCTGTAGATTTCCTCCCCCAAAAAACCGAATTACACTTTGCGAGGTGGAAAACATTTCATAGCAAAACAGCCCCAAACCAAACAATCCCTACGCCAATTCCATTCCGCCGGCAGGCGAAATCGGCTGCTGAGTGTTTGAAACTCCAATGGCAGCAGCAGCAACGAGTGCCGCGAATCACCTCAAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008886
ATGGCAGCAGCAGCAACGAGTGCCGCGAATCACCTCAAAACCGCGGGAAACGGCTTATTTCCCTCCAATTCCCGCCCTCGCCTTTTTCCTTCCAATTATGCCCCTCGATTCGTAGCCATGGCACCACAAAAGAAGGTAAATAAGTACGATTCGAAGTGGAAAAAGGAGTGGTTCGGCGCGGGACTATTCTACGAGGGCGGCGAGGAGCTAGAAGTGGACGTGTTCAAGAAGCTGGAGAAGAGGAAGGTGCTGAGCAGCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791970.1
MAAAATSAANHLKTAGNGLFPSNSRPRLFPSNYAPRFVAMAPQKKVNKYDSKWKKEWFGAGLFYEGGEELEVDVFKKLEKRKVLSSVEKAGLLSKAEEFGITLSTIEKLGLLSKAEDLGLLSLLEKAADSSPSALASAALPILVAAVLVVVVIPDDSAPLVAAQALIGGLLAVGGVGLFVGSIVLEGLQEGD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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