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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004892`

染色体: Chr02 坐标: 70959676-70960617 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004892`
名称	SmilChr02G004892
描述	uncharacterized SmilChr02G004892
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	70959676 - 70960617 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131008889`
GeneID	`131008889`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131008889`
原始查询	`SmilChr02G004892`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os05g0592000; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os05g0592000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G20970` (AT5G20970) HSP20-like chaperones superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832222] identity=24.8; qcov=0.559; evalue=2.53e-08; confidence=weak
Rice	`Os05g0592000` - identity=27.7; qcov=0.554; evalue=5.02e-09; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00011 (HSP20)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131008889

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057791974.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057791974.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057791974.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057791974.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057791974.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:70959905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:70959918`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A2,A24,B63,B91,C1,C4,C58
`Chr2:70959928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:70960476`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B110
`Chr2:70960476`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B110

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057791974.1

202 aa

101

202

HSP20

PF00011 HSP20 26-110 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057791974.1`	Pfam	`PF00011`	HSP20	Domain	26	110	5.1e-05	24.0	Hsp20/alpha crystallin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057935991.1
ATCTAATTATACACACACCACGTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTAGCAATGGCAACGACAGAGAGAGGTATGAATAAAAGAGAGTCAAGCTTGATTTTTACAGAGATAACGCCGCCTCACGGATGGAAGCAAGATCCAGATTTTCATTACTTACGCTTAACACTTCCTGGGTTTGAGGCAAACGACATCACTATACACATGGACAAATACGGGCATCTAGTGGTGCGCGGCACCAAACAAGTGACGGAGCACAAGTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131008889
ATGGCAACGACAGAGAGAGGTATGAATAAAAGAGAGTCAAGCTTGATTTTTACAGAGATAACGCCGCCTCACGGATGGAAGCAAGATCCAGATTTTCATTACTTACGCTTAACACTTCCTGGGTTTGAGGCAAACGACATCACTATACACATGGACAAATACGGGCATCTAGTGGTGCGCGGCACCAAACAAGTGACGGAGCACAAGTACATAAGCTTCGAGGAAACCTTCGACATCCCCACCGATGCTAAGCTCGACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057791974.1
MATTERGMNKRESSLIFTEITPPHGWKQDPDFHYLRLTLPGFEANDITIHMDKYGHLVVRGTKQVTEHKYISFEETFDIPTDAKLDDALGMFQDNQIYCVAIPKVKGQQQHAITMPKVDHNVNNPKPPDYKRDGASIHRYDTENNNNNDNNNNNEKPEVSRSRDYLKHIRGDKTKMKIAICVVTLIALIVITAVIIVKLRRR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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